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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002712`

染色体: Chr07 坐标: 26541879-26545797 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002712`
名称	SmilChr07G002712
描述	protein TWIN LOV 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26541879 - 26545797 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995723`
GeneID	`130995723`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995723`
原始查询	`LOC130995723`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TWIN LOV 1
产物	protein TWIN LOV 1
Arabidopsis	`AT2G02710` (PLPB) PAS/LOV protein B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814800] identity=63.4; qcov=0.934; evalue=4.14e-165; confidence=high
Rice	`Os01g0186200` (P0510F03.29-1) - identity=50.1; qcov=0.972; evalue=1.75e-115; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF00989 (PAS); PF08447 (PAS_3); PF13426 (PAS_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995723

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777102.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057777102.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777102.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777102.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777102.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26542119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:26542176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:26543338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr7:26543724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:26543748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:26543792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,C40,C55
`Chr7:26544425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:26544629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:26544756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr7:26544893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr7:26544912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777102.1

392 aa

196

392

PAS_9

PAS

PAS_3

PAS_9

PAS_3

PAS

PF13426 PAS_9 28-130 aa PF00989 PAS 43-122 aa PF08447 PAS_3 43-129 aa PF13426 PAS_9 262-354 aa PF08447 PAS_3 266-351 aa PF00989 PAS 266-352 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777102.1`	Pfam	`PF13426`	PAS_9	Domain	28	130	2.8e-41	140.7	PAS domain
`XP_057777102.1`	Pfam	`PF00989`	PAS	Domain	43	122	1.5e-16	61.1	PAS fold
`XP_057777102.1`	Pfam	`PF08447`	PAS_3	Domain	43	129	2.2e-17	63.8	PAS fold
`XP_057777102.1`	Pfam	`PF13426`	PAS_9	Domain	262	354	2.8e-41	140.7	PAS domain
`XP_057777102.1`	Pfam	`PF08447`	PAS_3	Domain	266	351	2.2e-17	63.8	PAS fold
`XP_057777102.1`	Pfam	`PF00989`	PAS	Domain	266	352	1.5e-16	61.1	PAS fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921119.1
GAAAGAAGCATACTCCAAGTTCGTGCGGTAGAAGTAGAAATTGTGGTTTAATAATAATAATAATCTGTTAAAAGAAAATAACCGATATAATTGGCAATGGTTATCTTTTTGTCAATAATTAAATAGATAGAGGCATAGCTAAAGGGAAGAAGCAACTCCCACTCGTGATTTTGGTCTTCGTTTGCAGTTTTGCACAAATCTGATGTGATTGAATTGTCGAAGAGCTAAAAATCTGGCCCATTTTGTGATTCTCCATAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995723
ATGGAATCACAATTGGGATTGGGTGAGAAGTCATTTGATTTGAGATACTCAGTGTGGGTGAGGGAAGCTCTGAATGAATTTCCTGATTGTTTCACCATAACCGATCCTTGTGTTCCTGGGCACCCTATTGTGTTTGCTTCAAAGGGATTCTTGAAAATGGTTGGTTATTCCAGAGAGGAGGTGGTTGGGAGGAACGGGAGGATGTTCCAGGGTCCGGAGACGGATAGGAGGTCGGTTATGGCGATTCGCGAGGCGATTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777102.1
MESQLGLGEKSFDLRYSVWVREALNEFPDCFTITDPCVPGHPIVFASKGFLKMVGYSREEVVGRNGRMFQGPETDRRSVMAIREAIREERAVQITLLNYRKDGTPFWMLFQMCPVFSKEDDRVINFVGVQVPLSRRPSLSGLRLRSDTSSSEDTVFRCCRREVCSDSILERGRASSVESVSSLDDQEDGINEPCEANELEKTKAGAAINNILSVLTHYSEYTGKLVSGKRCCPTGNARLVSSLNISLGRIKQSFVLTDAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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