当前解析结果
SmilChr07G002718| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002718 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002718 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002718 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 26640792 - 26648171 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130995728 |
|---|---|
| GeneID | 130995728 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995728 |
| 原始查询 | LOC130995728 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995728 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057777111.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057777111.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057777111.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777111.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777111.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:26645587 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B58,C17,C54 |
Chr7:26645602 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | B110,B33,B38,B39,B78,C20,C23,C75,D1 |
Chr7:26645610 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B58,C17,C54 |
Chr7:26645611 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B120,B32,B49,C35 |
Chr7:26645637 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B110,B95,C46,C56 |
Chr7:26645641 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B35,C24,C35 |
Chr7:26645679 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr7:26645686 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B2,B40,B45 |
Chr7:26645718 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B95,D6 |
Chr7:26645738 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B28,B58,C78,D11 |
Chr7:26645739 |
A |
AT |
1bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 9 | B31,B34,B42,B43,C17,C19,C25,C87,D1 |
Chr7:26645797 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。