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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002725`

染色体: Chr07 坐标: 26724436-26727506 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002725`
名称	SmilChr07G002725
描述	uncharacterized SmilChr07G002725
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26724436 - 26727506 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995736`
GeneID	`130995736`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995736`
原始查询	`LOC130995736`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832144]; symbol=AT5G20220; hit=AT5G20220; species=arabidopsis; confidence=high
产物	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832144]; symbol=AT5G20220; hit=AT5G20220; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G20220` (AT5G20220) zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832144] identity=59.5; qcov=0.99; evalue=2.08e-155; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0003727 (single-stranded RNA binding); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0045182 (translation regulator activity); GO:2000767 (positive regulation of cytoplasmic translation)
KEGG	-
Pfam	PF13696 (zf-CCHC_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995736

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057777119.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057777119.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777119.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777119.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777119.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26724669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B101
`Chr7:26724805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C11,C69
`Chr7:26725101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C11,C69
`Chr7:26725309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr7:26725616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B99
`Chr7:26726371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B75
`Chr7:26727334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777119.1

387 aa

194

387

zf-CCHC_2

PF13696 zf-CCHC_2 301-319 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777119.1`	Pfam	`PF13696`	zf-CCHC_2	Domain	301	319	7e-16	58.4	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921136.1
AATTAAACGCCCTTTCCTTCTTGCAATAGAAAAAGGTGGGTCCCACTTACCAATTTCACCTTCAAATGATGGCCGCAGATTCATTTCATCCATTGAGTTTCTGCTATGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAGAATGTACTATGCGTGCTCATCGTCGTTGAGGGTGATGATACCTCAATTGAGGTACAACAACAACAAGCTGCGCTATTGGATAATGCCGCATTCCATGCGAAGATTGAGCTTTGTAGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995736
ATGTACTATGCGTGCTCATCGTCGTTGAGGGTGATGATACCTCAATTGAGGTACAACAACAACAAGCTGCGCTATTGGATAATGCCGCATTCCATGCGAAGATTGAGCTTTGTAGCTTCACCCATCTCCTCCTCTTCCACAACTGACGACAACACTGCACCTTCCAAACACCCACAACTGCGATATGATCCTTCAGAGGAGCTATTCGGGCTTGCTGTTGATTTACAACCGAGGAATGTTGCTTCTGCTGCATCCAAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777119.1
MYYACSSSLRVMIPQLRYNNNKLRYWIMPHSMRRLSFVASPISSSSTTDDNTAPSKHPQLRYDPSEELFGLAVDLQPRNVASAASKPGSWIGPNGQYFRELPCPSCRGRGYTPCTECGIERSRPDCSLCSGKGLVTCNQCNGDCVIWEEWIDERPWEKARSVSPLKVKEDDEVDNLDIKLEGRRKTKRVYQSSAPEVNLKISRSLKSLNAKTGIFSNRMKIIHRDPMLHAQRVAAIKKTKGTAAARNHASEVMKNYFSDP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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