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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002726`

染色体: Chr07 坐标: 26727539-26731834 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002726`
名称	SmilChr07G002726
描述	single-stranded DNA-binding protein WHY1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26727539 - 26731834 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995737`
GeneID	`130995737`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995737`
原始查询	`LOC130995737`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	single-stranded DNA-binding protein WHY1, chloroplastic
产物	single-stranded DNA-binding protein WHY1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G14410` (WHY1) ssDNA-binding transcriptional regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838003] identity=71; qcov=0.761; evalue=5.98e-107; confidence=high
Rice	`Os06g0145800` - identity=64.6; qcov=0.696; evalue=4.28e-90; confidence=high
GO	GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF08536 (Whirly)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995737

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057777120.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057777120.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777120.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777120.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777120.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26728847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777120.1

277 aa

138

277

Whirly

PF08536 Whirly 102-236 aa

XP_057777121.1

276 aa

138

276

Whirly

PF08536 Whirly 101-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777120.1`	Pfam	`PF08536`	Whirly	Domain	102	236	7.3e-62	207.9	Whirly transcription factor
`XP_057777121.1`	Pfam	`PF08536`	Whirly	Domain	101	235	7.2e-62	207.9	Whirly transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092257.1
ACTTTAATTAATTAATTTTATGAGTATTTACTTTTTCGTTATGCGTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAACCACTTTTTCGTTATGCTTGAGTTGAAGATTGCGTGGATTATTGGCAGTTCCTACTTGAGTCTTGTGCACATCCGTTATTCCCTACGCCCTAAAACCTCTGATAAACCCTCAAACTGAATTCGAGCTCTCAAGGAAATTGAGAGAAAGAAAAAAAAGATAACCCAGTATGGTAATCCACAGTGTATGTGCAGG...

XR_009092255.1
ATTTTATGAGTATTTACTTTTTCGTTATGCGTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAACCACTTTTTCGTTATGCTTGAGTTGAAGATTGCGTGGATTATTGGCAGTTCCTACTTGAGTCTTGTGCACATCCGTTATTCCCTACGCCCTAAAACCTCTGATAAACCCTCAAACTGAATTCGAGCTCTCAAGGAAATTGAGAGAAAGAAAAAAAAGATAACCCAGTATGGTAATCCACAGTGTATGTGCAGGGCGAGGAGGAGGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995737
ATGGTAATCCACAGTGTATGTGCAGGGCGAGGAGGAGGGGTGATTTCAATTCCACAACCCAACAAATTGTCCGCTTTTAATTCCGCTATACCCACCTCAATTCTGTTCCCCAGAAAGAAAAATTCGTCTCTTTTTCCCTGCCCACTTCAATATCACTCTAAAAATGTATCATTGTGTGTGAAAAATCAGTACTTGACACCTCAAGATCAAAATCACGAGCAGCAGAAGTTTACCCCTTATGACTCTCGTTTCCCTTCGCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777120.1
MVIHSVCAGRGGGVISIPQPNKLSAFNSAIPTSILFPRKKNSSLFPCPLQYHSKNVSLCVKNQYLTPQDQNHEQQKFTPYDSRFPSQPAGQFPPRVYVGYSVYKGKAALTVEPRPPEFSPLDSGAFKLSKEGYVLLQFAPASGVRQYDWSRKQVFSLSVTEIGHIISLGASNSCEFFHDPNKGKSDEGRVRKVLKVEPLPDSSGHFFNLSVQNKITNVDEKIYIPITKAEFAVLVSSFNFVLPYLLGWHTFANSIKPEDA...

XP_057777121.1
MVIHSVCAGRGGGVISIPQPNKLSAFNSAIPTSILFPRKKNSSLFPCPLQYHSKNVSLCVKNQYLTPQDQNHEQQKFTPYDSRFPSQPGQFPPRVYVGYSVYKGKAALTVEPRPPEFSPLDSGAFKLSKEGYVLLQFAPASGVRQYDWSRKQVFSLSVTEIGHIISLGASNSCEFFHDPNKGKSDEGRVRKVLKVEPLPDSSGHFFNLSVQNKITNVDEKIYIPITKAEFAVLVSSFNFVLPYLLGWHTFANSIKPEDAN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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