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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002733`

染色体: Chr07 坐标: 26816941-26819307 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002733`
名称	SmilChr07G002733
描述	uncharacterized SmilChr07G002733
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26816941 - 26819307 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995745`
GeneID	`130995745`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995745`
原始查询	`LOC130995745`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01011 (PQQ); PF13360 (PQQ_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995745

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057777130.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777130.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777130.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777130.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777130.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26817392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B42,B43,C18,D7
`Chr7:26817401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B86,C17
`Chr7:26817447`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A2,A5,B71,C58,C62
`Chr7:26817447`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A2,A5,B71,C58,C62
`Chr7:26817475`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B10,B107,B109,B133,B16,C3,C41,C74
`Chr7:26817629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C77,C83
`Chr7:26817846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B70,C40,C52,C55,D11
`Chr7:26817849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C44
`Chr7:26817859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B66
`Chr7:26817859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr7:26817883`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A4,B107,B121,B133,B32,B4,C12
`Chr7:26817884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777130.1

529 aa

264

529

PQQ_2

PQQ

PQQ_2

PF13360 PQQ_2 59-305 aa PF01011 PQQ 199-375 aa PF13360 PQQ_2 365-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777130.1`	Pfam	`PF13360`	PQQ_2	Repeat	59	305	2.2e-23	83.8	Outer membrane protein assembly factor BamB
`XP_057777130.1`	Pfam	`PF01011`	PQQ	Repeat	199	375	8.4e-19	68.4	Glucose/ethanol/alcohol dehydrogenase, beta-propeller domain
`XP_057777130.1`	Pfam	`PF13360`	PQQ_2	Repeat	365	487	2.2e-23	83.8	Outer membrane protein assembly factor BamB

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921147.1
TGACATTACAGATTGCACCCCCCGCAACTTAATTCAGTATATATAAATTATAATCAGCATCCCGACTCCAATATTTTATCTAATCAATTATTTTCATCAATTGCCAAAAAGCCTCAACATCTTTTGCCTTTCCAGTTGCCAAATTATGGTTAACAATGGAATTATTATTGCAATCCTTCTCTTAGCATTTTGTTTCCTTTCATTTGTCGACAACTCAACTGCGGAGTGGTTAACCCATGGAGGAGACCTGAGCAACAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995745
ATGGTTAACAATGGAATTATTATTGCAATCCTTCTCTTAGCATTTTGTTTCCTTTCATTTGTCGACAACTCAACTGCGGAGTGGTTAACCCATGGAGGAGACCTGAGCAACAGAAGGAGTGAGATTGGAGGAAGCATCAATCCGATCTCAGTAGGATTAGGGCTGTTGAGACAGAGATGGAAGTTCTTGGCCGGATTCGACATAACCGCCACGCCGTCCGTGGCCGACGGAGTAGTCTACTTCCCGTCGTGGAACGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777130.1
MVNNGIIIAILLLAFCFLSFVDNSTAEWLTHGGDLSNRRSEIGGSINPISVGLGLLRQRWKFLAGFDITATPSVADGVVYFPSWNGNLYAVNARNGALIWQRSLGQLTGIPPSGLYVNMTVSRATPVVADDLLIVAIYGPAYVVAVTRSTGTLVWATRVDPGPLSIVTASGTVYNGGFYVGVSSLEELLAAGQCCTFRGSLVKLDVRSGRILWQTYTLPDNGGKLGGYSGAAIWGSSPSIDTWRGLVYVGTGNLYIAPAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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