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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002737`

染色体: Chr07 坐标: 26861108-26864518 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002737`
名称	SmilChr07G002737
描述	probable serine/threonine-protein kinase PBL3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26861108 - 26864518 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995748`
GeneID	`130995748`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995748`
原始查询	`LOC130995748`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable serine/threonine-protein kinase PBL3
产物	probable serine/threonine-protein kinase PBL3
Arabidopsis	`AT2G02800` (APK2B) protein kinase 2B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814810] identity=70; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0405100` (OsRLCK299) - identity=68.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995748

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777132.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777132.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777132.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777132.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777132.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26861339`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C68
`Chr7:26861339`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C68
`Chr7:26861355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,D11
`Chr7:26861444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C57,D4
`Chr7:26861655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr7:26861694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B48,B66,D5
`Chr7:26861950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B49,B78,C48
`Chr7:26862125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B78,C48
`Chr7:26862203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr7:26862705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777132.1

416 aa

208

416

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 86-360 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 87-362 aa

XP_057777133.1

414 aa

207

414

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 84-358 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 85-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777132.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	86	360	1.1e-42	147.0	Protein kinase domain
`XP_057777132.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	87	362	1e-45	156.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057777133.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	84	358	1.1e-42	147.0	Protein kinase domain
`XP_057777133.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	85	360	1e-45	156.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921150.1
GGTGGGACCGCACGCCTATACCATATGATATCGCCAAACAAATTCACTGAATGCTCAAACCAAAGCGAAGCAACCTTGAGAGAGAGAGAGAGGGAAGGCAGCCTCCCCCGAATTTCTACGCATTTTCCATCTCGCTTCGCTTTGAGCTCAGCCCTTTTCACACCGCACCCTTTCCTCTGCACAAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGCTACTTTCTTCTTCTGTTGTGCAATAAATATCTACTTTTTATCTTTACTGTTATCTA...

XM_057921149.1
AATGCTCAAACCAAAGCGAAGCAACCTTGAGAGAGAGAGAGAGGGAAGGCAGCCTCCCCCGAATTTCTACGCATTTTCCATCTCGCTTCGCTTTGAGCTCAGCCCTTTTCACACCGCACCCTTTCCTCTGCACAAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGCTACTTTCTTCTTCTGTTGTGCAATAAATATCTACTTTTTATCTTTACTGTTATCTACTTTCCTTGGTTCCACCTAAATTCACCAAAAGGCTGGCTCATTTTTAGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995748
ATGGGAAATTGCTTTGGTTCCTCTGCGAGAGTTGACGCTACCCTTAGCACCACATCTGAAGCATCACGATTCGCCTGCAAAAACAGCAATTCATCAGCTCCATCCAACATAAGCATTCCCTCGTACAGTGCTAAAAGCAGTGCCGAAAGCCTCCCGACTCCAAGATCAGAAGCTGAGATTCTGTCATCCCCTCATGTGAAGGCCTTCTCCTTTAATGAGTTAAAGAATGCAACCCGAAACTTTCGACCTGATAGTCTTCT...

LOC130995748
ATGGGAAATTGCTTTGGTTCCTCTGCGAGAGTTGACGCTACCCTTAGCACCACATCTGCTTCAGAAGCATCACGATTCGCCTGCAAAAACAGCAATTCATCAGCTCCATCCAACATAAGCATTCCCTCGTACAGTGCTAAAAGCAGTGCCGAAAGCCTCCCGACTCCAAGATCAGAAGCTGAGATTCTGTCATCCCCTCATGTGAAGGCCTTCTCCTTTAATGAGTTAAAGAATGCAACCCGAAACTTTCGACCTGATAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777132.1
MGNCFGSSARVDATLSTTSASEASRFACKNSNSSAPSNISIPSYSAKSSAESLPTPRSEAEILSSPHVKAFSFNELKNATRNFRPDSLLGEGGFGYVFKGWIDEHTLTAARPGSGLVIAVKKLKPEGFQGHKEWLTEVNYLGQLRHPNLVKLIGYCSDGDNRLLVYEFMPKGSLENHLFRRGPQPLSWATRIKVAIGAARGLSFLHEAEQQVIYRDFKASNILLDGEFNSKLSDFGLAKAGPTGDRTHVSTQVMGTHGYA...

XP_057777133.1
MGNCFGSSARVDATLSTTSEASRFACKNSNSSAPSNISIPSYSAKSSAESLPTPRSEAEILSSPHVKAFSFNELKNATRNFRPDSLLGEGGFGYVFKGWIDEHTLTAARPGSGLVIAVKKLKPEGFQGHKEWLTEVNYLGQLRHPNLVKLIGYCSDGDNRLLVYEFMPKGSLENHLFRRGPQPLSWATRIKVAIGAARGLSFLHEAEQQVIYRDFKASNILLDGEFNSKLSDFGLAKAGPTGDRTHVSTQVMGTHGYAAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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