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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002757`

染色体: Chr07 坐标: 27385203-27386735 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002757`
名称	SmilChr07G002757
描述	protein GAMETE CELL DEFECTIVE 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	27385203 - 27386735 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995766`
GeneID	`130995766`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995766`
原始查询	`LOC130995766`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein GAMETE CELL DEFECTIVE 1, mitochondrial
产物	protein GAMETE CELL DEFECTIVE 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT2G02880` (AT2G02880) mucin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814819] identity=62.1; qcov=0.939; evalue=7.23e-109; confidence=high
Rice	`Os03g0379400` - identity=53.7; qcov=0.916; evalue=9.06e-88; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995766

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057777160.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057777160.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.40000	`XP_057777160.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057777160.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777161.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:27385681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B133,B5,B77,D4
`Chr7:27385695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A8,B111,B3,B88
`Chr7:27385714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B135,C16,C33
`Chr7:27386132`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr7:27386136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr7:27386152`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr7:27386152`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr7:27386157`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A18
`Chr7:27386157`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A18
`Chr7:27386161`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A18
`Chr7:27386161`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A18
`Chr7:27386174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921178.1
AAAATAGAAAGTGAAGTAGAAATGAATGTTGTAAAGAAAAAGAAATTAGCTTGAGTTTATGATGATGCGCAGACTAGCCTCCGTCGTGAAAACCCACAACCTAAACCCTAACACCGCCGCCGTCCGCCCTCTCTCGACCAAACGAACTTCCAAAACCGGTGAGGAAGAGTGGAATGACGCGTGGGAAACTGCCTGGCTTCCCGACGACCTCTCGGGCAAATCCTCCCGCGCCCCATGGGAATCTGACGTCAGCTTCTCCC...

XM_057921177.1
AAAATAGAAAGTGAAGTAGAAATGAATGTTGTAAAGAAAAAGAAATTAGCTTGAGTTTATGATGATGCGCAGACTAGCCTCCGTCGTGAAAACCCACAACCTAAACCCTAACACCGCCGCCGTCCGCCCTCTCTCGACCAAACGAACTTCCAAAACCGGTGAGGAAGAGTGGAATGACGCGTGGGAAACTGCCTGGCTTCCCGACGACCTCTCGGGCAAATCCTCCCGCGCCCCATGGGAATCTGACGTCAGCTTCTCCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995766
ATGATGATGCGCAGACTAGCCTCCGTCGTGAAAACCCACAACCTAAACCCTAACACCGCCGCCGTCCGCCCTCTCTCGACCAAACGAACTTCCAAAACCGGTGAGGAAGAGTGGAATGACGCGTGGGAAACTGCCTGGCTTCCCGACGACCTCTCGGGCAAATCCTCCCGCGCCCCATGGGAATCTGACGTCAGCTTCTCCCTCCCTGCCGCCGCGGAGAATCCCCAAACTGCAATCTCCTCCCCGCCGGAAGAAATCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777160.1
MMMRRLASVVKTHNLNPNTAAVRPLSTKRTSKTGEEEWNDAWETAWLPDDLSGKSSRAPWESDVSFSLPAAAENPQTAISSPPEEIDTETKAFVEDMNDNWDQRKGKSAKKDSDRNAESSSTSSQSSSLYSLENIKRDYRLTKQKIHASLWAKEIEKQEEAKLGNFVSGADDIEKLLDSASEIFDSAPGNPKIGGSEFKNKPDGWETTSKNPDGNVWDMSQREEDILVQEFERRIAFNKFQVGTIQMPIYFFFVCVVISF...

XP_057777161.1
MMMRRLASVVKTHNLNPNTAAVRPLSTKRTSKTGEEEWNDAWETAWLPDDLSGKSSRAPWESDVSFSLPAAAENPQTAISSPPEEIDTETKAFVEDMNDNWDQRKGKSAKKDSDRNAESSSTSSQSSSLYSLENIKRDYRLTKQKIHASLWAKEIEKQEEAKLGNFVSGADDIEKLLDSASEIFDSAPGNPKIGGSEFKNKPDGWETTSKNPDGNVWDMSQREEDILVQEFERRIAFNKFQIASFIKQHIFSRRRPVDGW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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