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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002760`

染色体: Chr07 坐标: 27434868-27436292 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002760`
名称	SmilChr07G002760
描述	HVA22-like protein a
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	27434868 - 27436292 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995771`
GeneID	`130995771`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995771`
原始查询	`LOC130995771`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HVA22-like protein a
产物	HVA22-like protein a
Arabidopsis	`AT1G74520` (HVA22A) HVA22 homologue A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843793] identity=62.7; qcov=1.03; evalue=1.39e-79; confidence=high
Rice	`Os06g0226600` - identity=67.3; qcov=0.947; evalue=2.52e-74; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03134 (TB2_DP1_HVA22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995771

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057777164.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057777164.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057777165.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057777164.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777164.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:27435066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,C20,C49,C50,C58
`Chr7:27435113`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A21,A6,A9,B140,B20,B22,B28,B50,B58,B61,B89,C1,C32,C44,C6,C62,C68,C78
`Chr7:27435119`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A21,A6,A9,B140,B20,B22,B28,B50,B58,B61,B89,C1,C32,C44,C6,C62,C68,C78
`Chr7:27435273`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A18
`Chr7:27435273`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A18
`Chr7:27435587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B73,C7,C76,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777164.1

200 aa

100

200

TB2_DP1_HVA22

PF03134 TB2_DP1_HVA22 28-104 aa

XP_057777165.1

171 aa

171

TB2_DP1_HVA22

PF03134 TB2_DP1_HVA22 28-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777164.1`	Pfam	`PF03134`	TB2_DP1_HVA22	Family	28	104	4.5e-30	104.1	TB2/DP1, HVA22 family
`XP_057777165.1`	Pfam	`PF03134`	TB2_DP1_HVA22	Family	28	104	2.2e-30	105.1	TB2/DP1, HVA22 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921182.1
TTTGTTTTATGCATGCATGTACTAAACTAGCTACATGTGAACGTGGCGGACAGATAAAAAAATAATGTAGGAGGAGATGAAATGAAAAATTTACGACGACAAGAGGTGCTTTTTTTTTTTAAGAAAATAAATACCGAAAAAAAAAAAAAAGAGTGAAGCCTAGTTGTAGTACATTTGGGTTATAAAATTTTCCACCCTTTCACACTTCAACTTTCTTTTGGGCAGAAAACACGCATAAAATCATTGCATTAATTTACACA...

XM_057921181.1
CTTTTGGGCAGAAAACACGCATAAAATCATTGCATTAATTTACACACCTTTTCTTGTTTTTACTTCCCCATACGCACTGAGCCACTCACTTCATACACTCATTCTACAATATTATCTGTCACCACTAATTCCGGAAAAAAAAACAAGAAATTGAACTCAAATATGGGCTCTGGAGACAATCTCTTCACTGTTGTGGCAAAGAACATTGATGTTCTTGCTATGCCTCTGGTTTCTCTTGTTTATCCTCTGTATTGTTCAGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995771
ATGGGCTCTGGAGACAATCTCTTCACTGTTGTGGCAAAGAACATTGATGTTCTTGCTATGCCTCTGGTTTCTCTTGTTTATCCTCTGTATTGTTCAGTGAAGGCCATCGAGACAAAATCACGCACAGATGATCAGCAATGGCTGACATATTGGGTCCTCTACTCTCTCATCACCTTGTTCGAGCTCACATTCGCCAAACTTATCGAGTGGTTTCCCATTTGGTCTTACGCGAAGCTGGCGGGTGTGTGCTGGCTGGTGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777164.1
MGSGDNLFTVVAKNIDVLAMPLVSLVYPLYCSVKAIETKSRTDDQQWLTYWVLYSLITLFELTFAKLIEWFPIWSYAKLAGVCWLVLPHFNGAAYVYENFIRPFYKNPQIKMWYVPRKKDVFSKPDDVLSAAEKYIQENGPEAFERLIARVISIIHSTFNWFHLRELIMSRFLRLCRLTERQGPGEAATPSSMMIMSINS

XP_057777165.1
MGSGDNLFTVVAKNIDVLAMPLVSLVYPLYCSVKAIETKSRTDDQQWLTYWVLYSLITLFELTFAKLIEWFPIWSYAKLAGVCWLVLPHFNGAAYVYENFIRPFYKNPQIKMWYVPRKKDVFSKPDDVLSAAEKYIQENGPEAFERLIARADREARTRRSSYSIFHDDYEY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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