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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002766`

染色体: Chr07 坐标: 27521678-27524246 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002766`
名称	SmilChr07G002766
描述	protein PHYTOCHROME KINASE SUBSTRATE 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	27521678 - 27524246 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995779`
GeneID	`130995779`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995779`
原始查询	`LOC130995779`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PHYTOCHROME KINASE SUBSTRATE 1
产物	protein PHYTOCHROME KINASE SUBSTRATE 1
Arabidopsis	`AT2G02950` (PKS1) phytochrome kinase substrate 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814823] identity=31.9; qcov=0.989; evalue=2.37e-26; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0009638 (phototropism)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995779

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057777174.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057777174.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057777174.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777174.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777174.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:27521995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr7:27522254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr7:27522427`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	168	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A18,A21,A24,A25,A3,A4,A7,B1,B10,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B114,B115,B117,B119,B121,B122,B123,B125,B126,B129,B13,B130,B133,B135,B137,B139,B14,B140,B16,B17,B19,B2,B21,B22,B24,B25,B26,B29,B30,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B54,B57,B58,B59,B6,B62,B63,B66,B67,B69,B70,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B81,B82,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B95,B98,C10,C12,C13,C14,C16,C19,C20,C21,C22,C23,C26,C28,C29,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C46,C47,C49,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C6,C60,C65,C67,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C85,C86,D1,D10,D11,D3,D5,D7,D9
`Chr7:27522430`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	168	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A18,A21,A24,A25,A3,A4,A7,B1,B10,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B114,B115,B117,B119,B121,B122,B123,B125,B126,B129,B13,B130,B133,B135,B137,B139,B14,B140,B16,B17,B19,B2,B21,B22,B24,B25,B26,B29,B30,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B54,B57,B58,B59,B6,B62,B63,B66,B67,B69,B70,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B81,B82,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B95,B98,C10,C12,C13,C14,C16,C19,C20,C21,C22,C23,C26,C28,C29,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C46,C47,C49,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C6,C60,C65,C67,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C85,C86,D1,D10,D11,D3,D5,D7,D9
`Chr7:27522595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:27522902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr7:27522927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B81,B86,C17

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921191.1
TTTAGCTGTGTTGCAATATAGGAGAAATTGCCAGATAAGGATTTAGAAGGTACAAGATTTGTCAGAAACACATACTGTTGTTTTTCTATGATTTTCATGTGATGTGTAGTAAATTGACAAGTTTGTCTGATAACAAAAACATTTAAGATTGATTTCATTTATAGGTCTGTGCCGACAGTTAGTAGATTTTGGAATCAATGCCGACAGCATGACAAATTCATTTAGACAGCACCATTGTTTTTAGGGCAAGAGTTTATAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995779
ATGTCGATGCCCGTAACGACGCTGACTCCGCCTTCCAAACAACCATCCCAAATCATGAAAAACAGTACTAGTAGGGAAGGCCTCACCACCACACATGATCGCATCTTCCTCGGCAAGAACGCATCGGGAGACAAAGAGATCGACGTCTTTGATGCTCGCAAATACTTCAACGAGGGGCTGAACCACACTCCTAAAATCTGCACCAAGATCGTGCCGAATCACCATCATGATGATCATCAGCAGCAGCCGCAGCTCAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777174.1
MSMPVTTLTPPSKQPSQIMKNSTSREGLTTTHDRIFLGKNASGDKEIDVFDARKYFNEGLNHTPKICTKIVPNHHHDDHQQQPQLKKDVQTAVKEPPSAALSIRSQSSWNSRSALIRTASGRQQQLSKKSFLGSIGCNCSCLSSSIIGGRSKPDNKTSDHHFIKREKQEREREITFTAANPHKREQVFNMDTNLTMLTWDAITPLSVAEELKIPSISSEMHEDSNSDASSDLFEIESLYMDNPFDPTTCYAPSEASIEWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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