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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002771`

染色体: Chr07 坐标: 27570522-27573616 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002771`
名称	SmilChr07G002771
描述	60S ribosomal protein L34-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	27570522 - 27573616 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995784`
GeneID	`130995784`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995784`
原始查询	`LOC130995784`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L34-like
产物	60S ribosomal protein L34-like
Arabidopsis	`AT1G26880` (AT1G26880) Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838331] identity=89.2; qcov=1; evalue=1.01e-74; confidence=high
Rice	`Os08g0436800` - identity=91.5; qcov=0.975; evalue=2.88e-73; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit); GO:0042254 (ribosome biogenesis)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01199 (Ribosomal_L34e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995784

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057777179.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057777179.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777179.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777179.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777179.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:27570912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B37,B48,B66,D5
`Chr7:27570965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr7:27571819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A7,B1,B10,B110,B111,B125,B130,B134,B137,B4,B66,B82,B88,B94,C45,C49,C61,C68,C78,C79,D10,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777179.1

120 aa

120

Ribosomal_L34e

PF01199 Ribosomal_L34e 1-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777179.1`	Pfam	`PF01199`	Ribosomal_L34e	Family	1	96	9.9e-38	129.0	Ribosomal protein L34e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921196.1
AATCGAAATAGAAACAAAGTGGTAAGGGGTTAATGCTCAAGCCGTCTTCCTAAGCTCTCAAGTAGCAGAAGACGAGATTCACGTGGGAAAATGGTGCAGCGGCTGACCTACAGGAACCAATCACCACCGCATCGTCAAAACTCCCGGTAGATTCCTGACTTGAGACCTGCTGAGTACAAGAGGTCTAGATTATCCCAGAATCGTACAACTGCGAATTGTGCCTATGGTGGAGTCTTATCCAGTGCTGCTGTGAGGGAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995784
ATGGTGCAGCGGCTGACATACAGGAAGCGACATAGCTACGCAACGAAATCTAATCAGCATCGAGTCGTCAAAACTCCCGGAGGGAAGCTAGTGTATCAGAGCACCAAGAAGCGTGCAAGTGGTCCCAAGTGCCCTGTTACTGGAAAGAGGATCCAGGGGATTCCTCACTTGAGACCAGCCGAGTACAGGAGGTCTAGATTGCCCAGAAATCGTAGGACTGTCAACCGTGCCTATGGTGGAGTGCTATCTGGTGTAGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777179.1
MVQRLTYRKRHSYATKSNQHRVVKTPGGKLVYQSTKKRASGPKCPVTGKRIQGIPHLRPAEYRRSRLPRNRRTVNRAYGGVLSGVAVRERIIRAFLVEEQKIVKKVLKIQKTKEKLASKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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