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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr07G002821

染色体: Chr07 坐标: 28268355-28274247 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 IDSmilChr07G002821
名称SmilChr07G002821
描述phosphate transporter PHO1 homolog 10-like
染色体 / SeqIDChr07 / NC_080393.1
坐标与链方向28268355 - 28274247 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130995787
GeneID130995787
locus_tag-
NCBI 名称LOC130995787
原始查询LOC130995787

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述phosphate transporter PHO1 homolog 10-like
产物phosphate transporter PHO1 homolog 10-like
拟南芥AT1G69480 (AT1G69480)
EXS (ERD1/XPR1/SYG1) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843280]
identity=52.92; qcov=0.98; evalue=0.0; confidence=high
水稻Os01g0110100 (Pho1)
-
identity=39.49; qcov=0.635; evalue=5.84e-127; confidence=medium
GOGO:0000822 (inositol hexakisphosphate binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006817 (phosphate ion transport); GO:0015114 (GO:0015114); GO:0016036 (cellular response to phosphate starvation)
KEGG-
PfamPF03105 (SPX); PF03124 (EXS)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130995787

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序定位位置预测得分蛋白 ID
1 细胞膜 1.00000 XP_057777182.1
2 液泡 0.40000 XP_057777185.1
3 液泡膜 0.40000 XP_057777187.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 参考等位基因 变异等位基因 类型 影响 携带材料数 材料
Chr7:28269759 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B131
Chr7:28269760 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B34,C38
Chr7:28269914 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B34,C38
Chr7:28270019 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B51
Chr7:28270148 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D11
Chr7:28270854 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C81
Chr7:28270901 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A23,B129,B86,C17,D11
Chr7:28271054 AT A 1bp_deletion frameshift_variant 1 A19
Chr7:28271054 AT A 1bp_deletion CDS_variant 1 A19
Chr7:28271420 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A23,B129,B86,C17,D11
Chr7:28271661 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B34,C38
Chr7:28271929 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A23,B129,B86,C17,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777182.1
800 aa
N
1
400
800
SPX
EXS
C
PF03105 SPX 1-338 aa PF03124 EXS 429-765 aa
XP_057777184.1
800 aa
N
1
400
800
SPX
EXS
C
PF03105 SPX 1-338 aa PF03124 EXS 429-765 aa
XP_057777185.1
789 aa
N
1
394
789
SPX
EXS
C
PF03105 SPX 1-310 aa PF03124 EXS 418-754 aa
XP_057777186.1
765 aa
N
1
382
765
SPX
EXS
EXS
C
PF03105 SPX 1-338 aa PF03124 EXS 429-522 aa PF03124 EXS 511-730 aa
XP_057777187.1
716 aa
N
1
358
716
SPX
SPX
EXS
C
PF03105 SPX 1-56 aa PF03105 SPX 88-254 aa PF03124 EXS 345-681 aa
XP_057777188.1
683 aa
N
1
342
683
SPX
EXS
C
PF03105 SPX 3-221 aa PF03124 EXS 312-648 aa
XP_057777189.1
671 aa
N
1
336
671
SPX
EXS
C
PF03105 SPX 2-209 aa PF03124 EXS 300-636 aa
XP_057777190.1
604 aa
N
1
302
604
SPX
EXS
C
PF03105 SPX 19-142 aa PF03124 EXS 233-569 aa
XP_057777191.1
604 aa
N
1
302
604
SPX
EXS
C
PF03105 SPX 19-142 aa PF03124 EXS 233-569 aa
XP_057777192.1
538 aa
N
1
269
538
SPX
EXS
C
PF03105 SPX 2-76 aa PF03124 EXS 167-503 aa
XP_057777193.1
538 aa
N
1
269
538
SPX
EXS
C
PF03105 SPX 2-76 aa PF03124 EXS 167-503 aa
蛋白 ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value 得分 说明
XP_057777182.1 Pfam PF03105 SPX Domain 1 338 1.4e-62 213.5 SPX domain
XP_057777182.1 Pfam PF03124 EXS Family 429 765 3e-99 333.1 EXS family
XP_057777184.1 Pfam PF03105 SPX Domain 1 338 1.4e-62 213.5 SPX domain
XP_057777184.1 Pfam PF03124 EXS Family 429 765 3e-99 333.1 EXS family
XP_057777185.1 Pfam PF03105 SPX Domain 1 310 1.3e-45 157.6 SPX domain
XP_057777185.1 Pfam PF03124 EXS Family 418 754 3e-99 333.2 EXS family
XP_057777186.1 Pfam PF03105 SPX Domain 1 338 1.2e-62 213.7 SPX domain
XP_057777186.1 Pfam PF03124 EXS Family 429 522 5.4e-80 269.9 EXS family
XP_057777186.1 Pfam PF03124 EXS Family 511 730 5.4e-80 269.9 EXS family
XP_057777187.1 Pfam PF03105 SPX Domain 1 56 3.7e-43 149.6 SPX domain
XP_057777187.1 Pfam PF03105 SPX Domain 88 254 3.7e-43 149.6 SPX domain
XP_057777187.1 Pfam PF03124 EXS Family 345 681 2.3e-99 333.5 EXS family
XP_057777188.1 Pfam PF03105 SPX Domain 3 221 9.6e-40 138.4 SPX domain
XP_057777188.1 Pfam PF03124 EXS Family 312 648 2.1e-99 333.7 EXS family
XP_057777189.1 Pfam PF03105 SPX Domain 2 209 4.1e-34 119.8 SPX domain
XP_057777189.1 Pfam PF03124 EXS Family 300 636 2e-99 333.7 EXS family
XP_057777190.1 Pfam PF03105 SPX Domain 19 142 2.5e-29 104.1 SPX domain
XP_057777190.1 Pfam PF03124 EXS Family 233 569 1.5e-99 334.1 EXS family
XP_057777191.1 Pfam PF03105 SPX Domain 19 142 2.5e-29 104.1 SPX domain
XP_057777191.1 Pfam PF03124 EXS Family 233 569 1.5e-99 334.1 EXS family
XP_057777192.1 Pfam PF03105 SPX Domain 2 76 3.7e-24 87.1 SPX domain
XP_057777192.1 Pfam PF03124 EXS Family 167 503 1.1e-99 334.6 EXS family
XP_057777193.1 Pfam PF03105 SPX Domain 2 76 3.7e-24 87.1 SPX domain
XP_057777193.1 Pfam PF03124 EXS Family 167 503 1.1e-99 334.6 EXS family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

11 records

下载 cDNA FASTA
XM_057921199.1
AAAACGAAAGAATTCATCTAAAAAAAACGAAAGTGATGAAGATGAGATTAGGCAGGGCCTGTACAATTTACGAAGCTCTGGAGATAAAAGCTTCATCCTCTAAAAATGCATTTTGTCTGTTAGCCTAAAGTAGTGGCGCCACTGCTGACCACTGAAGCGATACGTGTTAGCAAATGGTGGGAAGATCGGTATTATAACATTTAACAATCGAATCGCCATTCATCCCATGCTTCCCAATCCACCATAAAGCAACACGCAAC...
XM_057921203.1
AAAACGAAAGAATTCATCTAAAAAAAACGAAAGTGATGAAGATGAGATTAGGCAGGGCCTGTACAATTTACGAAGCTCTGGAGATAAAAGCTTCATCCTCTAAAAATGCATTTTGTCTGTTAGCCTAAAGTAGTGGCGCCACTGCTGACCACTGAAGCGATACGTGTTAGCAAATGGTGGGAAGATCGGTATTATAACATTTAACAATCGAATCGCCATTCATCCCATGCTTCCCAATCCACCATAAAGCAACACGCAAC...

CDS

11 records

下载 CDS FASTA
lcl|NC_080393.1_cds_XP_057777182.1_38143
ATGAAATTTGGGAAAGAATTCAAGAAACAAAAGGTGTCGGAGTGGACAGAGGCATATGTCGACTACAACGGACTCAAACACATATTACATGGGATTCGCAGTTTTAGGCAGAACAATCCAAATCTAGCAAGAGCTTCTTCGAAAAGATTATCACTCAAGAACTTCAACAGTTCGAGTCTACATGAAAGCAATATCGACAACCATGATGATATTGAGAACCAAGTAATAGTTGTTCATACTGTGCATCAAGAGAATTCCAG...
lcl|NC_080393.1_cds_XP_057777184.1_38144
ATGAAATTTGGGAAAGAATTCAAGAAACAAAAGGTGTCGGAGTGGACAGAGGCATATGTCGACTACAACGGACTCAAACACATATTACATGGGATTCGCAGTTTTAGGCAGAACAATCCAAATCTAGCAAGAGCTTCTTCGAAAAGATTATCACTCAAGAACTTCAACAGTTCGAGTCTACATGAAAGCAATATCGACAACCATGATGATATTGAGAACCAAGTAATAGTTGTTCATACTGTGCATCAAGAGAATTCCAG...

Protein

11 records

下载 Protein FASTA
XP_057777182.1
MKFGKEFKKQKVSEWTEAYVDYNGLKHILHGIRSFRQNNPNLARASSKRLSLKNFNSSSLHESNIDNHDDIENQVIVVHTVHQENSRKLYNTRLIVSPTEGEGNERIFFKKLDDELNMTNNFYKDKVEEMIREAALLKKQMETLVALRIKVTNPSSHGLVSLKSVSTEINNLEPSKIIPPGKAEIFGQVDRKAGVEMSCRSQQQPGSSGVDLSFQERHSDSHPVVDVLHRNNSTNGEITDEYETSNLEILDRIKISNTYD...
XP_057777184.1
MKFGKEFKKQKVSEWTEAYVDYNGLKHILHGIRSFRQNNPNLARASSKRLSLKNFNSSSLHESNIDNHDDIENQVIVVHTVHQENSRKLYNTRLIVSPTEGEGNERIFFKKLDDELNMTNNFYKDKVEEMIREAALLKKQMETLVALRIKVTNPSSHGLVSLKSVSTEINNLEPSKIIPPGKAEIFGQVDRKAGVEMSCRSQQQPGSSGVDLSFQERHSDSHPVVDVLHRNNSTNGEITDEYETSNLEILDRIKISNTYD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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