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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002823`

染色体: Chr07 坐标: 28283468-28287031 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002823`
名称	SmilChr07G002823
描述	phosphate transporter PHO1 homolog 3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28283468 - 28287031 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995790`
GeneID	`130995790`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995790`
原始查询	`LOC130995790`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphate transporter PHO1 homolog 3-like
产物	phosphate transporter PHO1 homolog 3-like
Arabidopsis	`AT1G14040` (AT1G14040) EXS (ERD1/XPR1/SYG1) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837965] identity=61.5; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0110100` (Pho1) - identity=33; qcov=1.04; evalue=2.77e-144; confidence=low
GO	GO:0000822 (inositol hexakisphosphate binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006817 (phosphate ion transport); GO:0015114 (GO:0015114); GO:0016036 (cellular response to phosphate starvation)
KEGG	-
Pfam	PF03105 (SPX); PF03124 (EXS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995790

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777195.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777195.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777195.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777195.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777195.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28283913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C16
`Chr7:28284204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C82
`Chr7:28284242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C82
`Chr7:28284552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:28284685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B66,B89,B95
`Chr7:28285105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B137,B26,C57,D4
`Chr7:28285204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:28285811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,C38,C81
`Chr7:28285822`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A6
`Chr7:28285822`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A6
`Chr7:28286160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:28286296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777195.1

792 aa

396

792

SPX

EXS

PF03105 SPX 1-341 aa PF03124 EXS 430-766 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777195.1`	Pfam	`PF03105`	SPX	Domain	1	341	1.2e-75	256.4	SPX domain
`XP_057777195.1`	Pfam	`PF03124`	EXS	Family	430	766	4.4e-101	339.2	EXS family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921212.1
CTGTCACGCCCCAAAACAAAAAAACCATGAAGTATGGTAAAGAATTTGCTTCACAAATGGTGCCAGAATGGCAAGAAGCCTATACAGATTATAAATTCTTGAAAAGTCTTGTAAAAGAAATCCAAGTTTTCAAGCAAATAAACAGACCGGCCAAGCTGGCCGATCCTAGGCGAAGCAACACTCTGTACAGAGCCTTCAGTGGGCTAACACAGAGGGTGAACTCTCCAAGAGCTCATCAGGCTGCTGCAGCTGACATAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995790
ATGAAGTATGGTAAAGAATTTGCTTCACAAATGGTGCCAGAATGGCAAGAAGCCTATACAGATTATAAATTCTTGAAAAGTCTTGTAAAAGAAATCCAAGTTTTCAAGCAAATAAACAGACCGGCCAAGCTGGCCGATCCTAGGCGAAGCAACACTCTGTACAGAGCCTTCAGTGGGCTAACACAGAGGGTGAACTCTCCAAGAGCTCATCAGGCTGCTGCAGCTGACATAGAACATCAACCCATTCTCGTGCAGCACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777195.1
MKYGKEFASQMVPEWQEAYTDYKFLKSLVKEIQVFKQINRPAKLADPRRSNTLYRAFSGLTQRVNSPRAHQAAAADIEHQPILVQHVSRDGEERSETMFLMAADDGGQHELVYFKRLDAEFNKVLKFYRLKVDEVMKEAAVLNKQMEALIAFRVKVERPEGWTNSVEETTQLASDTAASRDALLANTPSAMKASRRIPLAVIDEESSTLSSQESEADRKQGNVEMKAVNARIQELKQNEIKAKRPAPLEILKRVTFNTSH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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