当前解析结果
SmilChr07G002818| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002818 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002818 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002818 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 28232753 - 28234317 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995803 |
|---|---|
| GeneID | 130995803 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995803 |
| 原始查询 | LOC130995803 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Arabinanase/levansucrase/invertase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241260]; symbol=AT1G26761; hit=AT1G26761; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | Arabinanase/levansucrase/invertase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241260]; symbol=AT1G26761; hit=AT1G26761; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G26761 (AT1G26761)Arabinanase/levansucrase/invertase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241260] identity=49.8; qcov=1.12; evalue=1.98e-142; confidence=high |
| Rice | Os08g0433300- identity=50.6; qcov=0.82; evalue=5.48e-97; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995803 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057777215.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 1.00000 | XP_057777215.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057777215.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777215.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777215.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:28232993 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,D9 |
Chr7:28233250 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B34,C38,D9 |
Chr7:28233331 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B107,C38,D9 |
Chr7:28233343 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr7:28233875 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B73,C83 |
Chr7:28234029 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 14 | A19,B100,B118,B120,B28,B6,B63,B65,B74,B83,C37,C56,C63,C67 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。