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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002772`

染色体: Chr07 坐标: 27585407-27586490 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002772`
名称	SmilChr07G002772
描述	zinc-finger homeodomain protein 8-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	27585407 - 27586490 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995817`
GeneID	`130995817`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995817`
原始查询	`LOC130995817`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc-finger homeodomain protein 8-like
产物	zinc-finger homeodomain protein 8-like
Arabidopsis	`AT1G69600` (ZFHD1) zinc finger homeodomain 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843296] identity=49.2; qcov=0.75; evalue=6.26e-50; confidence=medium
Rice	`Os08g0479400` (OsZHD2) - identity=37.5; qcov=0.93; evalue=4.06e-38; confidence=medium
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0050793 (regulation of developmental process)
KEGG	-
Pfam	PF04770 (ZF-HD_dimer)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995817

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777243.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777243.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777243.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777243.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777243.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:27585555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B29,B33,B67,C53
`Chr7:27585582`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B38
`Chr7:27585582`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B38
`Chr7:27585748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr7:27585997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:27586094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:27586240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B37,B48,B66,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777243.1

244 aa

122

244

ZF-HD_dimer

PF04770 ZF-HD_dimer 39-87 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777243.1`	Pfam	`PF04770`	ZF-HD_dimer	Family	39	87	1.5e-25	90.0	ZF-HD protein dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921260.1
TTGAGCATCGCCCTCTGCTTTCTGATCAGATGTTCTCATCATTTTAATCCCTTCCTTATTACACCAACAACCCTGCAATCCTCCCTTCAATTTTCCATTATTGGCCAATTAATCATCAAACTTTCCTCCCAAACCAAAACCCTAAATCAATATACCATTTCCCATCCTCCAAAAAAATTCTATTGCTTTCCTTGAAATCGATCTCTCTCTCACACACACTGCACGCACACTCAAATTAGCAATGGACCGAGACTTAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995817
ATGGACCGAGACTTAACCCCCACTAAAAGTGGTGATGAAACTGAAGTTGATACCCCACCGCACACGCACACTCACACCCCATCCATCAAGAGCCACCGCCGCCCGCCGCCGGCGTTCAAAGAATGCATGAAGAACCATGCAGCCAATATAGGCGGCCACGCAGTAGACGGCTGTGGAGAGTACATGCCGCCCTCCTCCGACGACCCTATCTCACTCATATGCGCCGCCTGCGGCTGCCACCGCAACTTCCACCGCCGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777243.1
MDRDLTPTKSGDETEVDTPPHTHTHTPSIKSHRRPPPAFKECMKNHAANIGGHAVDGCGEYMPPSSDDPISLICAACGCHRNFHRRHPAAITPPFLDFRRPGHTQTSSPSPPFHYGPHVLLALGTAEPAAENLQLGKKRSRTKFSQEQKERMHSFSEKLGWKMHRSDEAAVAEFCRDAGVARGVLKVWMHNNKGTTGARTGNVDVVGGRAMSINGSGGDKETRKTDDDNGGRCRNGSGGTLHFS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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