当前解析结果
SmilChr07G002832| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002832 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002832 |
| 描述 | cell division topological specificity factor homolog, chloroplastic |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 28376969 - 28379671 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130995819 |
|---|---|
| GeneID | 130995819 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995819 |
| 原始查询 | LOC130995819 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cell division topological specificity factor homolog, chloroplastic |
| 产物 | cell division topological specificity factor homolog%2C chloroplastic |
| Arabidopsis | AT1G69390 (MINE1)homologue of bacterial MinE 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843271] identity=59.6; qcov=0.983; evalue=7.69e-85; confidence=high |
| Rice | Os12g0498400 (minE)- identity=55.5; qcov=0.863; evalue=1.78e-69; confidence=high |
| GO | GO:0010020 (chloroplast fission); GO:0032955 (regulation of division septum assembly); GO:0051301 (cell division) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03776 (MinE) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995819 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057777246.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.80000 | XP_057777246.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057777246.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777246.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777246.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:28377190 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr7:28377194 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr7:28379476 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C27 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057777246.1PF03776
MinE 113-187 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057777246.1 |
Pfam | PF03776 |
MinE | Domain | 113 | 187 | 3.1e-15 | 56.4 | Septum formation topological specificity factor MinE |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。