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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002833`

染色体: Chr07 坐标: 28385595-28389826 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002833`
名称	SmilChr07G002833
描述	mitotic checkpoint protein BUB3.3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28385595 - 28389826 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995844`
GeneID	`130995844`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995844`
原始查询	`LOC130995844`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitotic checkpoint protein BUB3.3
产物	mitotic checkpoint protein BUB3.3
Arabidopsis	`AT1G69400` (AT1G69400) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843272] identity=49; qcov=0.955; evalue=6.45e-103; confidence=high
Rice	`Os03g0448600` (OsWD40-76) - identity=35.6; qcov=0.985; evalue=1.38e-65; confidence=medium
GO	GO:0000776 (kinetochore); GO:0007094 (mitotic spindle assembly checkpoint signaling); GO:0009524 (phragmoplast); GO:0033597 (mitotic checkpoint complex); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:1990298 (bub1-bub3 complex)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995844

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777271.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777270.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057777270.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777271.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777271.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28385881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:28385899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B129,B86,C17
`Chr7:28386905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr7:28387459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:28387511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr7:28388216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:28389458`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A15,B20,C21,C41,C62,C76
`Chr7:28389604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr7:28389662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777270.1

380 aa

190

380

WD40

PF00400 WD40 94-124 aa

XP_057777271.1

331 aa

166

331

WD40

PF00400 WD40 94-124 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777270.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	94	124	2.2e-13	50.8	WD domain, G-beta repeat
`XP_057777271.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	94	124	1.6e-13	51.3	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921287.1
CTATTTCAAAATACTTCCCACTTCTGAGTTCCCCAATTTCGAGAAATTCTTCGGTAGAATGAACGGTTCATGCTTGAATTTCGACAGCCCGATTCGAGACGCCATTTCCAGGATCCGGTTTGCTCCAGTTTCGAACAATCTTCTTATTTCCTCTTGGGATTCGAGTCTCCGACTTTTCGATGTGGATAAATGCGAGCTCAGATTCGAAGCTCCTAATGGAGGCTCGGCGGCGCTTCTAGATTGCTGTTTCGAGAGTGAAT...

XM_057921288.1
TATTTCAAAATACTTCCCACTTCTGAGTTCCCCAATTTCGAGAAATTCTTCGGTAGAATGAACGGTTCATGCTTGAATTTCGACAGCCCGATTCGAGACGCCATTTCCAGGATCCGGTTTGCTCCAGTTTCGAACAATCTTCTTATTTCCTCTTGGGATTCGAGTCTCCGACTTTTCGATGTGGATAAATGCGAGCTCAGATTCGAAGCTCCTAATGGAGGCTCGGCGGCGCTTCTAGATTGCTGTTTCGAGAGTGAATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995844
ATGAACGGTTCATGCTTGAATTTCGACAGCCCGATTCGAGACGCCATTTCCAGGATCCGGTTTGCTCCAGTTTCGAACAATCTTCTTATTTCCTCTTGGGATTCGAGTCTCCGACTTTTCGATGTGGATAAATGCGAGCTCAGATTCGAAGCTCCTAATGGAGGCTCGGCGGCGCTTCTAGATTGCTGTTTCGAGAGTGAATCAGTTGCTCTCGCTGCAAATTCTGATGGTTCCATTCTCAGGTATGACATGCGTGTGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777270.1
MNGSCLNFDSPIRDAISRIRFAPVSNNLLISSWDSSLRLFDVDKCELRFEAPNGGSAALLDCCFESESVALAANSDGSILRYDMRVGNSKAIGNHEDLATCIEYSEEKRQVISAGWDKKVQFWDPRSTSSLGCLSSLGKDVESMSLSGLLLMVAHKSSVHLYDLRYLDRSVQAKEYFMDAQIKCLRTNSELEGFVAGSIDGRVALRHVGQSNTNEGYAFRCHPKDRKGRQHLVAVNDIAFNPSLCGVVVTGDNEGYATMW...

XP_057777271.1
MNGSCLNFDSPIRDAISRIRFAPVSNNLLISSWDSSLRLFDVDKCELRFEAPNGGSAALLDCCFESESVALAANSDGSILRYDMRVGNSKAIGNHEDLATCIEYSEEKRQVISAGWDKKVQFWDPRSTSSLGCLSSLGKDVESMSLSGLLLMVAHKSSVHLYDLRYLDRSVQAKEYFMDAQIKCLRTNSELEGFVAGSIDGRVALRHVGQSNTNEGYAFRCHPKDRKGRQHLVAVNDIAFNPSLCGVVVTGDNEGYATMW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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