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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002856`

染色体: Chr07 坐标: 28706952-28708914 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002856`
名称	SmilChr07G002856
描述	uncharacterized SmilChr07G002856
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28706952 - 28708914 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995870`
GeneID	`130995870`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995870`
原始查询	`LOC130995870`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Son of sevenless protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839205]; symbol=AT1G26650; hit=AT1G26650; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Son of sevenless protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839205]; symbol=AT1G26650; hit=AT1G26650; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G26650` (AT1G26650) Son of sevenless protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839205] identity=64.5; qcov=0.886; evalue=1.02e-149; confidence=high
Rice	`Os07g0595900` - identity=46.3; qcov=0.825; evalue=1.65e-66; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29520 (DUF8558)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995870

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057777323.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057777323.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057777323.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057777323.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777323.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28707386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B34,C38
`Chr7:28707575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr7:28707779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,D6
`Chr7:28707875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,D3
`Chr7:28707965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D11
`Chr7:28708000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:28708223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B138,D3,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777323.1

359 aa

180

359

DUF8558

PF29520 DUF8558 45-341 aa

XP_057777324.1

359 aa

180

359

DUF8558

PF29520 DUF8558 45-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777323.1`	Pfam	`PF29520`	DUF8558	Domain	45	341	6.3e-43	148.0	Domain of unknown function (DUF8558)
`XP_057777324.1`	Pfam	`PF29520`	DUF8558	Domain	45	341	6.3e-43	148.0	Domain of unknown function (DUF8558)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921340.1
TTTTTTTTTTGAAACCAGTAAATGATTGAATTGAATCTGCTAAATACACTGCAAGTGTGTGTATATATATATACTATGGCTATGGCGACTTGAGTTCCCCTCTTCCACAACGTGAACAACCCCCAAAAATCCGCACCTTCAAAATCCAAAAATAGTCTCAATTTTTATTCTTCACACTCTCGATCAATCAAACACCGTCCTCTCGTTTTCAATATGGATTGAATCAACGTTTCTCCTTTTAGGTTGTTGATGGCATGTGG...

XM_057921341.1
TGAATTGAATCTGCTAAATACACTGCAAGTGTGTGTATATATATATACTATGGCTATGGCGACTTGAGTTCCCCTCTTCCACAACGTGAACAACCCCCAAAAATCCGCACCTTCAAAATCCAAAAATAGTCTCAATTTTTATTCTTCACACTCTCGATCAATCAAACACCGTCCTCTCGTTTTCAATGTTGTTGATGGCATGTGGAACTCACGTGGAAATTGAGGATTTGCCGTGCGATTTCGGAGAGGGAGAAAACTGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995870
ATGGAAGTCTCGAGCGGGCTGGGCCCGAGGCCCGGCTCGAGCGCATTGAGCAGAGAGAAACACGAGGAGAACGAAGGGATAAATATCGAGAATATCGAATTGGAGACGTCTGTGAATGATTTTCGTTCCAATCACCATTTTCATTCCATGAGTGCGTTGGACATTCTGAGAGAAACTGTTTGGATTCTTCGATTCAATTCAGGCGGATTCATGGCGATCGTGGCAGTGTTAATCTGCCCTGTTTCGGCCGTGCTCTTGTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777323.1
MEVSSGLGPRPGSSALSREKHEENEGINIENIELETSVNDFRSNHHFHSMSALDILRETVWILRFNSGGFMAIVAVLICPVSAVLLSNVLVDQSLVKRLSFRLLLVAKSSGLPLKPFVKQSCHRMAEMVISAAMCFPLLVTLLLLSKAAVVHTVDCTYSRKKFDFSKFYVIICKIWKRIVFTYLWGCLVMSGCLAFFIVLLVVVSCVFLIMGFPSDLILYPAMVVGLIFSIIFANAIIICNTAIVISVLEDVAGPQAVLR...

XP_057777324.1
MEVSSGLGPRPGSSALSREKHEENEGINIENIELETSVNDFRSNHHFHSMSALDILRETVWILRFNSGGFMAIVAVLICPVSAVLLSNVLVDQSLVKRLSFRLLLVAKSSGLPLKPFVKQSCHRMAEMVISAAMCFPLLVTLLLLSKAAVVHTVDCTYSRKKFDFSKFYVIICKIWKRIVFTYLWGCLVMSGCLAFFIVLLVVVSCVFLIMGFPSDLILYPAMVVGLIFSIIFANAIIICNTAIVISVLEDVAGPQAVLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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