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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003744`

染色体: Chr01 坐标: 55759079-55766653 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003744`
名称	SmilChr01G003744
描述	aldehyde dehydrogenase family 2 member C4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55759079 - 55766653 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995871`
GeneID	`130995871`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995871`
原始查询	`LOC130995871`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aldehyde dehydrogenase family 2 member C4-like
产物	aldehyde dehydrogenase family 2 member C4-like
Arabidopsis	`AT3G24503` (ALDH2C4) aldehyde dehydrogenase 2C4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822042] identity=68.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0591000` (ALDH1a) - identity=70.5; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004029 (aldehyde dehydrogenase (NAD+) activity)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00171 (Aldedh); PF05893 (LuxC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995871

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777329.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057777329.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057777329.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777329.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777329.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55759667`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C55
`Chr1:55759667`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C55
`Chr1:55759882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:55759905`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A19,B137
`Chr1:55759905`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A19,B137
`Chr1:55760885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:55761204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:55764498`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A7,A8,B102,B109,B110,B113,B12,B13,B32,B52,B59,B64,B74,C14,C15,C49,C52,C72,C87,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777329.1

502 aa

251

502

Aldedh

LuxC

PF00171 Aldedh 30-492 aa PF05893 LuxC 149-328 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777329.1`	Pfam	`PF00171`	Aldedh	Family	30	492	3.6e-178	593.6	Aldehyde dehydrogenase family
`XP_057777329.1`	Pfam	`PF05893`	LuxC	Family	149	328	1.5e-05	24.8	Acyl-CoA reductase (LuxC)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921346.1
TATATATATTGGAACATAGGACGATAGAGGAAGACCACACACACACACACGCATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGAGTGGGGAAAGAAATGGCCACGTGGAGGAATCGACGATCATGATTCCTAAAGTGAAGTTCACAAAGCTCTTCATCAATGGAGAGTTCGTTGATTCAGTATCAGGGAAAACTTTTGAGACAATTGATCCAAGAAGCGAAGAAGTGATTGGTAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995871
ATGAGTGGGGAAAGAAATGGCCACGTGGAGGAATCGACGATCATGATTCCTAAAGTGAAGTTCACAAAGCTCTTCATCAATGGAGAGTTCGTTGATTCAGTATCAGGGAAAACTTTTGAGACAATTGATCCAAGAAGCGAAGAAGTGATTGGTAAGGTTGCGGAAGGCGATAAGGAAGATGTGGACTTGGCGGTCAAGGCTGCCCGTGAGGCGTTCGATCACGGCCCATGGCCCAGACTGCCCGGATCTGAAAGGCGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777329.1
MSGERNGHVEESTIMIPKVKFTKLFINGEFVDSVSGKTFETIDPRSEEVIGKVAEGDKEDVDLAVKAAREAFDHGPWPRLPGSERRKIMLKFADLIEQNLEELAALDAMDAANLYLLGKIVMINNGIELFRYYAGAADKIHGETLKMSKQLHGYTLLEPIGVVGHIIPWNFPTQMFSMKVAPALAAGCTMVVKPAEQTPLSALFYAHLAKLAGVPDGVLNVVTGYGSTVGAAISSHMDIDMVSFTGSTVTGHRIMQAAAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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