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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002897`

染色体: Chr07 坐标: 29351007-29353612 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002897`
名称	SmilChr07G002897
描述	uncharacterized SmilChr07G002897
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	29351007 - 29353612 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995888`
GeneID	`130995888`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995888`
原始查询	`LOC130995888`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995888

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777361.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777361.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777361.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777361.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777361.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:29351936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B53,B97,C45,C82
`Chr7:29352892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B53,B63,C61,C74
`Chr7:29352922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B32,C83
`Chr7:29352926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	38	A10,A11,A3,A6,A7,B101,B103,B107,B108,B109,B115,B13,B132,B139,B19,B32,B38,B40,B50,B61,B63,B65,B68,B69,B72,B82,B93,B98,C11,C16,C20,C3,C50,C69,C70,C74,D10,D6
`Chr7:29352962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B123,B14
`Chr7:29352962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B14
`Chr7:29353085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,C16,C41,D8
`Chr7:29353093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C21,C46
`Chr7:29353121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr7:29353132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A15,B106,B113,B123,B135,B17,B3,B47,B53,B63,B66,B74,B78,B80,B99,C19,C54,C55,C56,C61,C79,C8,C84,D5,D7
`Chr7:29353133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B123,C40,C7,C71
`Chr7:29353133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,C40,C7,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777361.1

119 aa

119

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 6-106 aa

XP_057777362.1

119 aa

119

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 6-106 aa

XP_057777363.1

99 aa

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 2-86 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777361.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	6	106	1.7e-11	45.1	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)
`XP_057777362.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	6	106	1.7e-11	45.1	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)
`XP_057777363.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	2	86	1.1e-06	29.6	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092303.1
GCCTGTCTGTAATCCCTCCGCCGCCTGTCTGCTTCAAACCGCCGCCGCCTTCTTCCTCTGCCTGAGGAGTAGTGTCATCGCTACTACCCCCTCACTCTGCTCTCATCAGTTTTGCTCCGTCGTCGCGCCGCGTGCTCCCTACGCCGGAGCTAGGCCAAAATTAGTGCTTCAATTTATGGGTATCAAAGGGATGAATATTGCTCATGTCAAGAGCCATTTGTAGACTCTTGCTGGCCTTATTAGCGATGGAACTATGACGG...

XR_009092304.1
GCCTGTCTGTAATCCCTCCGCCGCCTGTCTGCTTCAAACCGCCGCCGCCTTCTTCCTCTGCCTGAGGAGTAGTGTCATCGCTACTACCCCCTCACTCTGCTCTCATCAGTTTTGCTCCGTCGTCGCGCCGCGTGCTCCCTACGCCGGAGCTAGGCCAAAATTAGTGCTTCAATTTATGGGTATCAAAGGGATGAATATTGCTCATGTCAAGAGCCATTTGTAGACTCTTGCTGGCCTTATTAGCGATGGAACTATGACGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130995888
ATGTTATCCGGAATGAAGAAAATCAGCAATAGGAATAAAGATAATAGATCAAAGTTACAGATGAATCATGCATGCGGAACAAAATCTATTGCACAGTTTTGCTACGAAGAGCGTGACAATGAAACTAGAGAGGAGCCTAGTCACACAACTGCATGGAGATTGAGCCGTTATAGTAACACGAAAAAGGACTGGATCGATGAGGCCTCAAAGGAAGTTTATGATGAGCTTATGAAGTTGCAAGCTGAAGACATTGAAGATCC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057777361.1
MLSGMKKISNRNKDNRSKLQMNHACGTKSIAQFCYEERDNETREEPSHTTAWRLSRYSNTKKDWIDEASKEVYDELMKLQAEDIEDPMSEDEAFVKVLGEEKSSRLQECGDGLKPPSKR

XP_057777362.1
MLSGMKKISNRNKDNRSKLQMNHACGTKSIAQFCYEERDNETREEPSHTTAWRLSRYSNTKKDWIDEASKEVYDELMKLQAEDIEDPMSEDEAFVKVLGEEKSSRLQECGDGLKPPSKR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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