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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000990`

染色体: Chr01 坐标: 20894555-20898686 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000990`
名称	SmilChr01G000990
描述	uncharacterized SmilChr01G000990
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	20894555 - 20898686 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995916`
GeneID	`130995916`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995916`
原始查询	`LOC130995916`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995916

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777428.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777428.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777428.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777428.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777428.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:20894596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B140,D7
`Chr1:20894607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B140,D7
`Chr1:20895127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C8
`Chr1:20895136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B66,B70
`Chr1:20895150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B56,B70,C85
`Chr1:20895154`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	47	A14,A15,A20,A7,B104,B111,B112,B126,B127,B130,B134,B135,B137,B19,B21,B23,B25,B29,B34,B45,B50,B53,B56,B65,B66,B74,B78,B81,B83,B90,B99,C1,C25,C27,C3,C39,C40,C43,C47,C48,C5,C55,C66,C70,C71,C80,D9
`Chr1:20895155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B7,C7,C85
`Chr1:20895185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B17,C77,D7
`Chr1:20895190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,C77,C85
`Chr1:20895212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B53,B70,C61
`Chr1:20895214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:20895230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B69,B7,B9,C68,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777428.1

718 aa

359

718

DUF1985

DUF8566

PF09331 DUF1985 79-212 aa PF29561 DUF8566 91-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777428.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	79	212	1.2e-12	48.7	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057777428.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	91	233	3.8e-08	34.1	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921445.1
GCCTCTCGCCGTCTCCCTCTCGTCTGTTGTCGTCTCCCTCTCGCCTTTCAACAAAGTCAAGCTTTCAACCGGCGAACTCAGGCTCTGAACGAGCTCAGCCTCTCAGATCCTCGCCGGCTCCGTTTTTCCGGTGGACGTTCTTTGACTCCCTCTCGGATCTCTACCGGCGAAGTATCAGTTTTCTACCACCTGAAATCTCGTCAGCTTCTCTCCATTTCCGTCATGGATGCACCGCATGAGGAGAATTCTAATTATTTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995916
ATGGATGCACCGCATGAGGAGAATTCTAATTATTTGAGGCCGAGTACAATTAATGTGGCTTCACATGTTGGGACATATTACAAGACAAAATACTTGAAAATGGTTAGGAAGGTATTGAATGAGAAAGGTGGTCAACCGTTGGTGGACAGATTTTTAAGTGGTTGTTTCGGACACTCATTAGATTGGAATCCGGGGTCAAAGTGTGCTATGGCTGTTCACCATGTAGTTTCTCGCCAAATCCGATCAAATGATAATGGATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777428.1
MDAPHEENSNYLRPSTINVASHVGTYYKTKYLKMVRKVLNEKGGQPLVDRFLSGCFGHSLDWNPGSKCAMAVHHVVSRQIRSNDNGLWFFINGSRLNFSERDYALVTWLNFGETDFDTRAHHDLRNVEVFRKFCCGQRTVKVETLVDLFENYDIDDHDESLLLRVAHVLVLYDMLLGYEPDKNVADWVWTLVNDLDAFTQFSWAAYTYQLLCQYVNNSSTHDKYKLYGPVWALHVWSLEIIPELGTAVGTHLDGGAHPRC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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