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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003025`

染色体: Chr07 坐标: 31289731-31300315 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003025`
名称	SmilChr07G003025
描述	protein ESMERALDA 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	31289731 - 31300315 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995934`
GeneID	`130995934`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995934`
原始查询	`LOC130995934`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ESMERALDA 1-like
产物	protein ESMERALDA 1-like
Arabidopsis	`AT2G01480` (AT2G01480) O-fucosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814676] identity=78.4; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0841200` - identity=75.5; qcov=0.679; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10250 (O-FucT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995934

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057777425.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057777425.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777425.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777425.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777425.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:31290174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B94,C87
`Chr7:31290174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C87
`Chr7:31290188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B99,C26,C74
`Chr7:31290192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C87
`Chr7:31290203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr7:31290205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,C76
`Chr7:31290207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr7:31290218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C54,C70
`Chr7:31290235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C87
`Chr7:31290236`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B53,B66,B99,C26,C74
`Chr7:31290236`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B53,B66,B99,C26,C74
`Chr7:31290245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777425.1

560 aa

280

560

O-FucT

PF10250 O-FucT 152-482 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777425.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	152	482	5.2e-101	339.4	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921442.1
AAAATAGTTGAATAAGACGAGTGTTTTTGAATTAAAAAGGAAAAAACAAGAAGAAGAGCGCTAGTCCTTAAAATCGAAGAAGGTTAAGGAAAATGGAGAGTTGACTCGCTTAAAAAGGTCAAAATCAATTTCTCTCTCTTGAATTTCTGCCATCATCCTCTAATTCTATCATTCCCCCTACTGTCTGTTGTCCTGTCTGTCCATTGTTCCAAGCACGTGCGTCCCTCTCTCACGTCACGTGCACCACCACCACCTCTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995934
ATGCACGCCTACAATCGGCTCCCGAGCAGCGGACAAAGCAGCCCCCAATCCCCGCCCTCGTCGCCGCTCAGCCGCTCCCCGCGCTACCGCCACCGCGGCTCCAAATCGGGCCGCCCGCCGCCCAAGACGCTCGCGCAGCGCCTCGTCTGGATCCTGCTCTCTTTCCTCCTCAAGCGCCAGGGGATTTTCCTCTTCGCGCCTCTTCTCTACATCTCCGGTATGCTCTTCTACATGGGAACGGTGTCGTTTGACGTCGTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777425.1
MHAYNRLPSSGQSSPQSPPSSPLSRSPRYRHRGSKSGRPPPKTLAQRLVWILLSFLLKRQGIFLFAPLLYISGMLFYMGTVSFDVVPVIKHRPPPGSIYRSPQLYAKLRPEMDSDNSSADAISTIWKHSYKVGEWRPCISKSFEGLPESNGFIFVEANGGLNQQRTSICNAVAVAGYLNATLVIPNFHYHSIWRDPSKFGDIYDEEFFIKTLENDVRIVGTIPGYIMERFDHNMSNVYNFRIKAWSSIKYYTDTVLPKLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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