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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003065`

染色体: Chr07 坐标: 32150444-32153002 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003065`
名称	SmilChr07G003065
描述	pectinesterase-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	32150444 - 32153002 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995939`
GeneID	`130995939`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995939`
原始查询	`LOC130995939`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase-like
产物	pectinesterase-like
Arabidopsis	`AT1G23200` (AT1G23200) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838928] identity=52.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0312500` (OsPME3) - identity=45.6; qcov=1.03; evalue=6.52e-148; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995939

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057777431.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777431.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777431.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777431.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777431.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:32150704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C27,C58
`Chr7:32150947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:32150955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C27,C58
`Chr7:32151081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:32151239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D7
`Chr7:32151270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr7:32152208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B106,B34,B45,C46
`Chr7:32152237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D7
`Chr7:32152269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C46
`Chr7:32152305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:32152508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,C54
`Chr7:32152789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777431.1

522 aa

261

522

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 31-168 aa PF01095 Pectinesterase 209-508 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777431.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	31	168	2e-25	90.5	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057777431.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	209	508	4.2e-140	466.4	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921448.1
ATAAAAGCTGCCCCTATAAATATAACGACTCCAATTCCTACACCCTAACTATTTGTAACATTATTTTAGCTTCATCACAAAATCTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCATGGATAAACGACTTTCTACTCTTGCAATATTCCTATATTTTCACATACTTTTGTCACATTTTAGATTGGCAAAATGTGGCAATGCAACGACCTCAATTTGCACCCACACACCTCACCCCGAACTCTGCAACACTCTGCAAACCACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995939
ATGGATAAACGACTTTCTACTCTTGCAATATTCCTATATTTTCACATACTTTTGTCACATTTTAGATTGGCAAAATGTGGCAATGCAACGACCTCAATTTGCACCCACACACCTCACCCCGAACTCTGCAACACTCTGCAAACCACCTTCTCTGATGAAACCCTAGATAAAAACGACGTCGATTTAGGCCAGCTAAGCCTTAGAGAAACCCTAGCACAAGCTGCAAAAGCCCACAAGCTCATCTCAGAGATGGAGTGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777431.1
MDKRLSTLAIFLYFHILLSHFRLAKCGNATTSICTHTPHPELCNTLQTTFSDETLDKNDVDLGQLSLRETLAQAAKAHKLISEMEWSSFDELGRSAWDDCLELYQDTIYQLNRSIVSKIDAQTWLSAAIANEQTCHSGFLDFNMSSHLESLQIMLADYSKTLANSLAINKAISSSSTSKQKRDSDYFPDWVSARDRRLLRSSGGSIKADIMVAQDGSGDYTTISEGLAAAKRRGGGLRRFVIYVKKGVYRENVEIKRSMK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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