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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003030`

染色体: Chr07 坐标: 31346352-31352262 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003030`
名称	SmilChr07G003030
描述	perakine reductase-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	31346352 - 31352262 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995951`
GeneID	`130995951`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995951`
原始查询	`LOC130995951`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	perakine reductase-like
产物	perakine reductase-like
Arabidopsis	`AT1G60680` (AT1G60680) NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842362] identity=56.6; qcov=0.881; evalue=1.57e-133; confidence=high
Rice	`Os10g0419100` - identity=70.6; qcov=0.871; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004033 (GO:0004033); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF00248 (Aldo_ket_red)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995951

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777457.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777457.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777457.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777457.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777457.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:31346413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr7:31346414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,C19,D1
`Chr7:31346484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C81
`Chr7:31350522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B37,B67,C79
`Chr7:31350605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C1
`Chr7:31351212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr7:31351481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777457.1

387 aa

194

387

Aldo_ket_red

PF00248 Aldo_ket_red 63-355 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777457.1`	Pfam	`PF00248`	Aldo_ket_red	Domain	63	355	1.3e-81	274.6	Aldo/keto reductase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921474.1
TGACATTTGGTGTACATGCAGCCAAGTTTCAGCCACGTTGTTTTCAGATTTATTCATCAATCCTATTTAATCACTCAAACCTTCATTCCACCTTCATTTTCGCCTCACCACACAGACCACTTACTGCTCCAGCTTTCAGCAATGGCTGCGCAAAATTCTGTGGAAAGAGTAAACTTGGGAAACCAAGGACTTGAGGTGTCAAAACTGGGTTATGGTTGCATGGGGCTCACTGGATTCTACAATGCACCTATTTCTGTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995951
ATGCAGCCAAGTTTCAGCCACGTTGTTTTCAGATTTATTCATCAATCCTATTTAATCACTCAAACCTTCATTCCACCTTCATTTTCGCCTCACCACACAGACCACTTACTGCTCCAGCTTTCAGCAATGGCTGCGCAAAATTCTGTGGAAAGAGTAAACTTGGGAAACCAAGGACTTGAGGTGTCAAAACTGGGTTATGGTTGCATGGGGCTCACTGGATTCTACAATGCACCTATTTCTGTGGAAGATGGGATTGCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777457.1
MQPSFSHVVFRFIHQSYLITQTFIPPSFSPHHTDHLLLQLSAMAAQNSVERVNLGNQGLEVSKLGYGCMGLTGFYNAPISVEDGIAIIKEAFNKGITFFDTADVYGKDHSNEYLIGQALKELPREKVQLATKFGFYAFTSSGIIVKGTPEYARTCCEASLKRLQVDYIDLYYIHRIDTTVPIEETMEELKKLVEEGKIKYIGLSEANADTIRRAHAVHPITALQMEYSLWTRDIEEEIIPLCRELGIGIVPYCPVGRGLF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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