当前解析结果
SmilChr07G002943| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002943 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002943 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002943 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 29804164 - 29805225 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130995983 |
|---|---|
| GeneID | 130995983 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995983 |
| 原始查询 | LOC130995983 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0501400; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os12g0501400; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G69080 (AT1G69080)Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843240] identity=40.09; qcov=0.986; evalue=2.54e-54; confidence=medium |
| Rice | Os12g0501400- identity=51.8; qcov=0.977; evalue=1.36e-64; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00582 (Usp) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995983 |
特征证据限制:抽查两个保留的历史缓存共 206 行,PROFEAT 特征全部为零;第二块缓存为 106 行,比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实,不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测,也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选,特征完整性与预测可靠性尚未建立。
| Rank | 定位位置 | 中文 | 五折投票比例 | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057777498.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:29804327 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B50,B81 |
Chr7:29804327 |
TA |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B50,B81 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057777498.1PF00582
Usp 50-194 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057777498.1 |
Pfam | PF00582 |
Usp | Domain | 50 | 194 | 1.4e-16 | 62.1 | Universal stress protein family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。