当前解析结果
SmilChr07G003045| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003045 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003045 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003045 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 31584194 - 31586007 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995991 |
|---|---|
| GeneID | 130995991 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995991 |
| 原始查询 | LOC130995991 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843415]; symbol=AT1G70780; hit=AT1G70780; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843415]; symbol=AT1G70780; hit=AT1G70780; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G70780 (AT1G70780)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843415] identity=64.5; qcov=1.04; evalue=2.04e-58; confidence=high |
| Rice | Os02g0324700- identity=50.6; qcov=0.61; evalue=9.87e-23; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF23156 (DUF7054) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995991 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.40000 | XP_057777507.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057777507.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057777507.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057777507.1 |
| 5 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057777507.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:31584564 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B38 |
Chr7:31584564 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B38 |
Chr7:31585101 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B36,B82,C19,D1 |
Chr7:31585300 |
A |
ATT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 110 | A1,A13,A14,A15,A16,A23,A5,A7,A8,B102,B103,B104,B105,B109,B112,B113,B114,B115,B118,B120,B124,B127,B128,B129,B130,B132,B135,B136,B139,B15,B17,B2,B20,B21,B24,B26,B27,B3,B30,B37,B40,B42,B43,B50,B51,B53,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B63,B65,B67,B68,B69,B70,B71,B73,B74,B76,B78,B81,B85,B91,B95,B96,C12,C13,C14,C16,C21,C22,C23,C25,C29,C30,C33,C37,C39,C4,C41,C43,C45,C47,C55,C56,C57,C6,C60,C62,C63,C67,C7,C72,C74,C76,C78,C8,C84,C85,C87,C9,D1,D4,D6,D8,D9 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057777507.1PF23156
DUF7054 14-96 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057777507.1 |
Pfam | PF23156 |
DUF7054 | Domain | 14 | 96 | 8.7e-29 | 100.0 | Domain of unknown function (DUF7054) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。