当前解析结果
SmilChr07G003017| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003017 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003017 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003017 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 31188868 - 31190665 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995997 |
|---|---|
| GeneID | 130995997 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995997 |
| 原始查询 | LOC130995997 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os11g0516100; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os11g0516100; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G55125 (AT5G55125)Ribosomal protein L31 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241018] identity=81; qcov=0.784; evalue=1.15e-30; confidence=medium |
| Rice | Os11g0516100- identity=76.6; qcov=0.865; evalue=1.09e-33; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995997 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057777515.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057777515.1 |
| 3 | Nucleolus | 核仁 | 0.20000 | XP_057777515.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057777515.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777515.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:31189051 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D2 |
Chr7:31189071 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 60 | A10,A13,A15,A23,A4,A5,A7,B10,B102,B110,B119,B12,B120,B122,B125,B126,B13,B131,B139,B16,B17,B21,B40,B41,B46,B50,B52,B54,B59,B61,B62,B63,B65,B73,B76,B81,B89,B92,C1,C16,C27,C28,C33,C34,C36,C41,C44,C45,C5,C56,C6,C61,C66,C7,C72,C73,C74,C78,C8,C81 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。