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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003099`

染色体: Chr07 坐标: 32819326-32821702 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003099`
名称	SmilChr07G003099
描述	nudix hydrolase 17, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	32819326 - 32821702 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996059`
GeneID	`130996059`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996059`
原始查询	`LOC130996059`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nudix hydrolase 17, mitochondrial
产物	nudix hydrolase 17%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT2G01670` (NUDT17) nudix hydrolase homolog 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814696] identity=50.3; qcov=1.13; evalue=8.25e-51; confidence=high
Rice	`Os02g0734300` - identity=40.2; qcov=1.16; evalue=4.2e-35; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016462 (pyrophosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00293 (NUDIX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996059

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777547.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057777546.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057777550.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777546.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777546.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:32820193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777546.1

170 aa

170

NUDIX

PF00293 NUDIX 46-151 aa

XP_057777547.1

171 aa

171

NUDIX

PF00293 NUDIX 46-152 aa

XP_057777548.1

160 aa

160

NUDIX

PF00293 NUDIX 35-141 aa

XP_057777549.1

159 aa

159

NUDIX

PF00293 NUDIX 35-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777546.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	46	151	1.7e-11	44.9	NUDIX domain
`XP_057777547.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	46	152	1.5e-09	38.7	NUDIX domain
`XP_057777548.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	35	141	2.1e-09	38.2	NUDIX domain
`XP_057777549.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	35	140	2.3e-11	44.6	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921563.1
AAACATCAAAGAAACTGAGCAGGGGTTGGACTTAGATCAACCTTTGAAGTCTGAAACAAGTCGTGACGCGTCTGTATATACACACGACACACCCCGCAGCGCCCACCTTTTTTTGCTTCTCTCTTATCTTCATTTCAAACTTTTACATCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTATATATATAGCCTTCACTGGGGAGGGGAGCCCTCCAATAAAATCCTTTTCTTCATTTATTTGCGCTTGTCGTTTCTTCTATCTCATATAAAT...

XM_057921565.1
AAACTTTTACATCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTATATATATAGCCTTCACTGGGGAGGGGAGCCCTCCAATAAAATCCTTTTCTTCATTTATTTGCGCTTGTCGTTTCTTCTATCTCATATAAATACACTAATTAAGTGGAATCCATATTAATCATACATGATGTTATGTATGGCTGCTCGCACTGGGAGGAATTTGCAGAGATGCATTCCGTATCGATACAAGTGTGAGAAGATGAATGGTAGTTCAGAAGATGAGTTGG...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC130996059
ATGATGTTATGTATGGCTGCTCGCACTGGGAGGAATTTGCAGAGATGCATTCCGTATCGATACAAGTGTGAGAAGATGAATGGTAGTTCAGAAGATGAGTTGGAAGTTCTTGTAATCAGTTCTAAGAAGACTGAAGCAATGATGTTTCCAAAGGGAGGTTGGGAGAGTGACGAGTCCGTTGAAGAAGCTGCTTGTCGCGAGTCACTGGAAGAAGCCGGAGTTGTCGGAAAAGTGGAGTGTGAATTGGGAAGGTGGGTATT...

LOC130996059
ATGATGTTATGTATGGCTGCTCGCACTGGGAGGAATTTGCAGAGATGCATTCCGTATCGATACAAGTGTGAGAAGATGAATGGTAGTTCAGAAGATGAGTTGGAAGTTCTTGTAATCAGTTCTAAGAAGACTGAAGCAATGATGTTTCCAAAGCAGGGAGGTTGGGAGAGTGACGAGTCCGTTGAAGAAGCTGCTTGTCGCGAGTCACTGGAAGAAGCCGGAGTTGTCGGAAAAGTGGAGTGTGAATTGGGAAGGTGGGT...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057777546.1
MMLCMAARTGRNLQRYNNQHHRLVVGCIPYRYKCEKMNGSSEDELEVLVISSKKTEAMMFPKGGWESDESVEEAACRESLEEAGVVGKVECELGRWVFKSKSRELYHQGFMFPLLVTQQLDLWPEHTARTREWMSVSEARKACQQWWMREALDILVNRLKSPSLEQKNQD

XP_057777547.1
MMLCMAARTGRNLQRYNNQHHRLVVGCIPYRYKCEKMNGSSEDELEVLVISSKKTEAMMFPKQGGWESDESVEEAACRESLEEAGVVGKVECELGRWVFKSKSRELYHQGFMFPLLVTQQLDLWPEHTARTREWMSVSEARKACQQWWMREALDILVNRLKSPSLEQKNQD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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