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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003163`

染色体: Chr07 坐标: 33614227-33617281 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003163`
名称	SmilChr07G003163
描述	adagio protein 3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33614227 - 33617281 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996073`
GeneID	`130996073`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996073`
原始查询	`LOC130996073`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adagio protein 3
产物	adagio protein 3
Arabidopsis	`AT1G68050` (FKF1) flavin-binding, kelch repeat, f box 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843133] identity=78.9; qcov=0.928; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0547000` (FKF1) - identity=76.8; qcov=0.907; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0007623 (circadian rhythm); GO:0009637 (response to blue light); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex)
KEGG	smil04712 (Circadian rhythm - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07646 (Kelch_2); PF13426 (PAS_9); PF24681 (Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996073

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777570.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057777570.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057777570.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777570.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777570.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33614527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B50,B57
`Chr7:33614527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B57
`Chr7:33614588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C39
`Chr7:33614713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B131,C1,C2
`Chr7:33614780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr7:33615160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr7:33615228`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C76
`Chr7:33615228`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C76
`Chr7:33615232`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C76
`Chr7:33615232`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C76
`Chr7:33615257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C1,C65
`Chr7:33615992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777570.1

623 aa

312

623

PAS_9

Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7

Kelch_2

PF13426 PAS_9 63-164 aa PF24681 Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7 289-482 aa PF24681 Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7 476-619 aa PF07646 Kelch_2 529-576 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777570.1`	Pfam	`PF13426`	PAS_9	Domain	63	164	1.6e-13	51.5	PAS domain
`XP_057777570.1`	Pfam	`PF24681`	Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7	Repeat	289	482	1.3e-52	179.0	KLHDC2/KLHL20/DRC7 Kelch-repeats domain
`XP_057777570.1`	Pfam	`PF24681`	Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7	Repeat	476	619	1.3e-52	179.0	KLHDC2/KLHL20/DRC7 Kelch-repeats domain
`XP_057777570.1`	Pfam	`PF07646`	Kelch_2	Repeat	529	576	2.7e-27	94.0	Kelch motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921587.1
ACCGACGAAAGAAGTCCAATCTGAGAAGCCACTTGGAACATATCTATAGTTTAGCTCTTGCATCTTGGCACCAACAGTAGAATATATATATATATATGTACACCTAAATATACAGTTTTACTCAGAGAGAGAGAGAGATGAGAATGGAAGATAGCGAAGACGAGGAGGAGCGCGACCGCATGTTCCGGAAGCGGCTCAAGTGCGGCGACGATGCCGATTATATGGAGCAGGACGGCGGAGCCGATGTATTTCCACATGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996073
ATGAGAATGGAAGATAGCGAAGACGAGGAGGAGCGCGACCGCATGTTCCGGAAGCGGCTCAAGTGCGGCGACGATGCCGATTATATGGAGCAGGACGGCGGAGCCGATGTATTTCCACATGCGGCGGCTGACCCCTTGTTCTACTCACCGGAGCTGGCACCGACGTCGATCGTTGTGTCGGATGTGATGGAGCCGGACTTCCCGGTCATATATGTCAACACAGTCTTCGAGTTCTCCACTGGATTTCGCGCCGACGAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777570.1
MRMEDSEDEEERDRMFRKRLKCGDDADYMEQDGGADVFPHAAADPLFYSPELAPTSIVVSDVMEPDFPVIYVNTVFEFSTGFRADEVLGRNCRFLQFRDPRAKRRHPLVDPVVVSEMRRCLEEGVEFHGELLNFRKDGTPLINSLRLMPIHSDDGVVTHVIGIQIFTEAKLDLNNVSYPVFKETYQQQSDKLVEPFQVGGGILHSQQQEVCVLLQLSDEVIAQNILSRLTPRDVASIGSVCRRIRLLTKNEHVRKMVCQN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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