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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003115`

染色体: Chr07 坐标: 33057194-33061584 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003115`
名称	SmilChr07G003115
描述	patatin-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33057194 - 33061584 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996077`
GeneID	`130996077`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996077`
原始查询	`LOC130996077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	patatin-like protein 2
产物	patatin-like protein 2
Arabidopsis	`AT2G26560` (PLA2A) phospholipase A 2A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817197] identity=56.7; qcov=0.783; evalue=1.15e-151; confidence=high
Rice	`Os11g0614400` (OspPLAIItheta) - identity=53.6; qcov=0.783; evalue=3.42e-149; confidence=high
GO	GO:0004620 (glycerophospholipase activity); GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0047372 (monoacylglycerol lipase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01734 (Patatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996077

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057777576.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057777576.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777576.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777576.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777576.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33057486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C32
`Chr7:33057806`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B20
`Chr7:33057806`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B20
`Chr7:33057825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr7:33057898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B47,B91,C9,D10
`Chr7:33058807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,B63
`Chr7:33058823`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A20
`Chr7:33058823`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A20
`Chr7:33058834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:33059357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr7:33061126`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A1,B95,C61
`Chr7:33061126`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A1,B95,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777576.1

498 aa

249

498

Patatin

PF01734 Patatin 20-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777576.1`	Pfam	`PF01734`	Patatin	Domain	20	226	5.7e-26	92.6	Patatin-like phospholipase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921593.1
TACATGTATCAATTTCTATAGTTTTCAATTTCATTTCAAATTTTCACACATGCACGCATTGTATACATATCAATAAATAAGACGTATCGTTGTGCATTATCTACATCACATATATCAATAAGTAGTTCCATTTTTTTGTCTTATCAATGGAAAGGACCTCATTTTTCCATGAACCAAAGAAGCAGCAAAGATATGTGACGGTCCTCAGCATCGACGGCGGCGGCATCAAAGGTATCCTCCCCGCCGTTATCCTGGAGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996077
ATGGAAAGGACCTCATTTTTCCATGAACCAAAGAAGCAGCAAAGATATGTGACGGTCCTCAGCATCGACGGCGGCGGCATCAAAGGTATCCTCCCCGCCGTTATCCTGGAGTGCCTGGAGTCGCAGCTGCAGGCATTAGACGGCGAGGAAGCAAGAATAGCAGACTACTTCGACGTGATAGCCGGGACGAGCACAGGCGGCCTCGTCACGGCCATGCTCACAGCTCCGGACAAAAACAATCGCCCTCTTTACGCTGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777576.1
MERTSFFHEPKKQQRYVTVLSIDGGGIKGILPAVILECLESQLQALDGEEARIADYFDVIAGTSTGGLVTAMLTAPDKNNRPLYAAKDIKPFYLNNCPKIFPQPHCQSLFPFVKWVKSLKGPLYDGGHLHKVLTETLKDTKLSDAITNVIIPAFDIKLLQPVIFSTYEARKSALANAKLSDICISTSAAPTFLPGHKFATHDGKGSVRKYNLIDGGVAANNPALIAVAEVTKQMFDSNVNFFHTRPSDYPRLLTISLGTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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