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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003177`

染色体: Chr07 坐标: 33842854-33844633 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003177`
名称	SmilChr07G003177
描述	sec14 cytosolic factor-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33842854 - 33844633 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996088`
GeneID	`130996088`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996088`
原始查询	`LOC130996088`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sec14 cytosolic factor-like
产物	sec14 cytosolic factor-like
Arabidopsis	`AT1G14820` (AT1G14820) Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838047] identity=60.7; qcov=0.956; evalue=2.74e-103; confidence=high
Rice	`Os01g0926800` (P0482D04.19) - identity=32.3; qcov=0.904; evalue=4.63e-43; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00650 (CRAL_TRIO); PF03765 (CRAL_TRIO_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996088

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057777598.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777598.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057777598.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777598.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777598.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33844149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777598.1

250 aa

125

250

CRAL_TRIO_N

CRAL_TRIO

PF03765 CRAL_TRIO_N 24-50 aa PF00650 CRAL_TRIO 75-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777598.1`	Pfam	`PF03765`	CRAL_TRIO_N	Domain	24	50	4.4e-05	24.3	CRAL/TRIO, N-terminal domain
`XP_057777598.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	75	226	4e-27	95.6	CRAL/TRIO domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921615.1
CTACAAAGAAAATTGAACAACAATAAATATTGAACAAGATCTCCTAAGTAAAAAAGATATACATACTCGTATAATATTTTTTCATTTTTAAATACAAGAATTCATTTAATAAATTTTTAAAACAAATTCCTATATAAATATATATTGGAGTCAAAACTCATTTAACAGGTGAAGACTTACAACAGCTGCATTCTTCTCTCTCTAAAGATGAACCAGAATGAAGAACTGGCAGTAGCCCAGATGAGGAGAGCCGTTCACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996088
ATGAACCAGAATGAAGAACTGGCAGTAGCCCAGATGAGGAGAGCCGTTCACAAGCTGGGTTCTTCCACTGAGGGATATGGAGACACAACTCTGAAAAGATTCTTGGTGGCGAGATCCTTCAACATAGATAAGGCAGCGAAGATGTTTGTGCAATGGCGGAATTGGAGGGCTTCGTTTGTGCCCCTCAATCACATTCCTGAATCCCAAATTGGTGATGAACTGCAGCAGAATAAAATATTCCTGCAGGGGCTTTCACCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777598.1
MNQNEELAVAQMRRAVHKLGSSTEGYGDTTLKRFLVARSFNIDKAAKMFVQWRNWRASFVPLNHIPESQIGDELQQNKIFLQGLSPAGNPVVAVKVHRHVPGKDQLQFKKFVVHLLDKTIASGFREKEIGNEKLVAVLDLQKLAYKNIDIRGMITGFQFLQDYYPERLSKCFLLNMPGFFVRVWRLISRFLEKATLEKIVIVSNEEERRALIREVGADVLPEEYGGQAKFILIQDFQLNNKPLEEKTLLT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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