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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003261`

染色体: Chr07 坐标: 34416061-34418124 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003261`
名称	SmilChr07G003261
描述	60S ribosomal protein L17-1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	34416061 - 34418124 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996145`
GeneID	`130996145`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996145`
原始查询	`LOC130996145`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L17-1-like
产物	60S ribosomal protein L17-1-like
Arabidopsis	`AT1G27400` (AT1G27400) Ribosomal protein L22p/L17e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839630] identity=91.6; qcov=0.96; evalue=7.27e-117; confidence=high
Rice	`Os09g0258600` - identity=87.1; qcov=0.977; evalue=3.64e-111; confidence=high
GO	GO:0002181 (cytoplasmic translation); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00237 (Ribosomal_L22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996145

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057777634.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777634.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777634.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777634.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777634.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:34416290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr7:34416426`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A25,A4,B130,B14,B19,B24,B29,B32,B54,B62,B87,B9,C10,C22,C74,C85
`Chr7:34416587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B78
`Chr7:34416589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C75
`Chr7:34416620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B28,C27,C50,C84,D10
`Chr7:34416620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,C27,C50,C84,D10
`Chr7:34416625`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	B138,B36,B49,B56,B58,B69,B95,B96,C13,C19,C38,C4,C41,C43,C45,C60,C72,C87,D1
`Chr7:34416816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr7:34416858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B41,B82,B86,C17,C28,C7
`Chr7:34416870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B72,B98
`Chr7:34416972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,D9
`Chr7:34417948`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777634.1

174 aa

174

Ribosomal_L22

PF00237 Ribosomal_L22 17-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777634.1`	Pfam	`PF00237`	Ribosomal_L22	Domain	17	152	7.1e-33	113.6	Ribosomal protein L22p/L17e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921651.1
CTTCCTCAGTTTCTGCAGTACCGCCGAAAAAGAACAGCTGCAACAATGGTGAAATACTCGAGGGAGCCCGATAACATCACTAAATCTTGCAAGGCTAGGGGATCTGATCTCAGAGTTCATTTCAAGAACACTAGGGAGACAGCGCACGCCATCAGGAAGTTGCCTTTGGGCAAGGCCAAGAGGTACTTGGAGGATGTGCTTGCCCACAAACAGGCCATACCTTTCACTCGTTTCTGTGGTGGTGTTGGGCGAACTGCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996145
ATGGTGAAATACTCGAGGGAGCCCGATAACATCACTAAATCTTGCAAGGCTAGGGGATCTGATCTCAGAGTTCATTTCAAGAACACTAGGGAGACAGCGCACGCCATCAGGAAGTTGCCTTTGGGCAAGGCCAAGAGGTACTTGGAGGATGTGCTTGCCCACAAACAGGCCATACCTTTCACTCGTTTCTGTGGTGGTGTTGGGCGAACTGCTCACGCCAAGAACAGACACTCTAACGGACAAGGTCGCTGGCCAGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777634.1
MVKYSREPDNITKSCKARGSDLRVHFKNTRETAHAIRKLPLGKAKRYLEDVLAHKQAIPFTRFCGGVGRTAHAKNRHSNGQGRWPVKSAKFILDLLKNAESNAQVKGLDVDALFISHIQVNQAQKQRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIELILSEKQEPVKKEPESQLATSKPRKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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