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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003278`

染色体: Chr07 坐标: 34521315-34523091 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003278`
名称	SmilChr07G003278
描述	vacuolar iron transporter 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	34521315 - 34523091 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996152`
GeneID	`130996152`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996152`
原始查询	`LOC130996152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar iron transporter 1
产物	vacuolar iron transporter 1
Arabidopsis	`AT2G01770` (VIT1) vacuolar iron transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814708] identity=78.8; qcov=0.967; evalue=8.91e-138; confidence=high
Rice	`Os09g0396900` (OsVIT2) - identity=75.3; qcov=0.983; evalue=5.1e-131; confidence=high
GO	GO:0005381 (iron ion transmembrane transporter activity); GO:0005384 (manganese ion transmembrane transporter activity); GO:0005774 (vacuolar membrane); GO:0006880 (GO:0006880); GO:0030026 (intracellular manganese ion homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF01988 (VIT1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996152

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057777644.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057777644.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057777644.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777644.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777644.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:34521570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A2,B117,B24,B7,B94,C3,C71
`Chr7:34521620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr7:34521626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr7:34521637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B90,B92,C4,C60
`Chr7:34521691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,D3
`Chr7:34521697`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	211	A1,A11,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A5,A8,A9,B1,B10,B100,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B119,B120,B121,B122,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B14,B15,B17,B18,B19,B2,B21,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B57,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D7,D8,D9
`Chr7:34521704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,D3
`Chr7:34521805`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A1,A14,A19,A25,A3,A9,B10,B103,B110,B114,B129,B136,B14,B17,B21,B37,B61,B64,B74,B8,B80,B9,C11,C15,C28,C41,C52,C62
`Chr7:34521825`	`T`	`TA`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	23	B1,B107,B110,B115,B12,B18,B30,B46,B90,B92,B93,B98,B99,C26,C36,C39,C4,C50,C73,C8,C82,C87,D6
`Chr7:34521836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:34521849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A1,A14,A19,A25,A3,A9,B10,B103,B110,B129,B136,B14,B21,B37,B48,B61,B64,B74,B8,B80,B9,C11,C15,C28,C41,D10
`Chr7:34521852`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	95	A1,A14,A15,A19,A2,A21,A25,A3,A9,B1,B10,B103,B104,B106,B107,B11,B110,B115,B12,B120,B129,B130,B135,B136,B138,B14,B17,B18,B21,B28,B30,B31,B33,B34,B35,B37,B4,B43,B46,B47,B48,B5,B61,B63,B64,B65,B66,B70,B71,B74,B8,B80,B83,B9,B90,B92,B98,B99,C10,C11,C14,C15,C21,C26,C28,C36,C39,C4,C41,C44,C45,C46,C50,C51,C52,C53,C56,C57,C59,C62,C7,C72,C73,C76,C79,C8,C82,C83,C87,C9,D1,D10,D2,D4,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777644.1

239 aa

120

239

VIT1

PF01988 VIT1 24-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777644.1`	Pfam	`PF01988`	VIT1	Family	24	234	1.8e-74	250.9	VIT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921661.1
AATCAAATACACGAGGGCACTCAATTTTGCGACGCATGGCACGCTTGGTCTACAGATTAATTAAAAATAGAAAAAGATTAATAATGAGATATGGAAAGTAGGATGGAAGCGCTAGCGCACATATATATATATATATATATATAGTGCTGTTGTGATCCACAGATAGAGGTAGAGGAAATAAAAATGGCAGGAGAATCGAACGCGTCTCTGCTGAATCAGCACAAAGAGAAGCATTTCACCGCCGGCGAGATCGTGCGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996152
ATGGCAGGAGAATCGAACGCGTCTCTGCTGAATCAGCACAAAGAGAAGCATTTCACCGCCGGCGAGATCGTGCGAGACATCATCATCGGGGTTTCTGATGGTCTCACGGTGCCCTTCGCCCTCGCCGCGGGTCTCTCCGGCGCCAACGCCACCTCCGCCGTCATTGTCACCGCCGGAGTCGCTGAGATCGCCGCCGGCGCAATCTCCATGGGCCTCGGAGGTTACTTGGCTGCAAAAAGCGAGGCGGATCATTACATGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777644.1
MAGESNASLLNQHKEKHFTAGEIVRDIIIGVSDGLTVPFALAAGLSGANATSAVIVTAGVAEIAAGAISMGLGGYLAAKSEADHYMRELQREQDEIIDVPDTEAAEVAEILSEYGIQPHEYSPVVNALRKNPKAWLDFMMKFELGLEKPDPKRAVQSALTIAIAYIVGGIVPLFPYMLISSADRAVVASIIVTLMALLVFGYGKGHFTGSKPFWSALQTAFIGAIASAAAFGMAKLVQG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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