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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003291`

染色体: Chr07 坐标: 34681910-34682756 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003291`
名称	SmilChr07G003291
描述	uncharacterized SmilChr07G003291
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	34681910 - 34682756 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996162`
GeneID	`130996162`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996162`
原始查询	`LOC130996162`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0438700; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os07g0438700; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G05590` (AT2G05590) TLD-domain containing nucleolar protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815108] identity=62.9; qcov=0.946; evalue=1.09e-24; confidence=medium
Rice	`Os07g0438700` - identity=69.7; qcov=0.892; evalue=1.5e-25; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07534 (TLD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996162

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777652.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057777652.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057777652.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777652.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777652.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:34682073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:34682124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr7:34682569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B10,B109,B118,B120,B137,B48,B60,B77,B84,B97,C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777652.1

80 aa

TLD

PF07534 TLD 11-72 aa

XP_057777653.1

74 aa

TLD

PF07534 TLD 11-66 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777652.1`	Pfam	`PF07534`	TLD	Domain	11	72	1.9e-13	51.4	TLDc domain
`XP_057777653.1`	Pfam	`PF07534`	TLD	Domain	11	66	8.8e-08	33.0	TLDc domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921669.1
TATCCATGTTATGGATTTCGTCGTTCCATTAGACTGTTAGTTGATAACTTGATATTAAAATCTCAGTTTGGAAGTTGCCATAGTAGTACTTGATATGACCAGGCTGTTACAATCTCAGAACTGATGTATCTTTATCCATTTATTACTTGTATAGGTGCAAACAGATACTTCTATTTGTGCTTGAATGATTTGATTGCTTTCGGTGGAGGTGCAAGCTTTGCTCTGTGCTTGAACGAAGATCTATTATCTGGAACCAGTGG...

XM_057921670.1
TATCCATGTTATGGATTTCGTCGTTCCATTAGACTGTTAGTTGATAACTTGATATTAAAATCTCAGTTTGGAAGTTGCCATAGTAGTACTTGATATGACCAGGCTGTTACAATCTCAGAACTGATGTATCTTTATCCATTTATTACTTGTATAGGTGCAAACAGATACTTCTATTTGTGCTTGAATGATTTGATTGCTTTCGGTGGAGGTGCAAGCTTTGCTCTATTATCTGGAACCAGTGGCCCTTGTGAAACATTTGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996162
ATGTATCTTTATCCATTTATTACTTGTATAGGTGCAAACAGATACTTCTATTTGTGCTTGAATGATTTGATTGCTTTCGGTGGAGGTGCAAGCTTTGCTCTGTGCTTGAACGAAGATCTATTATCTGGAACCAGTGGCCCTTGTGAAACATTTGGGAACTCGTGTTTAGCTCATGTTCAAGAGTTTGTATTGAAGGATGTTGAGCTGTGGGGTTTTACGCACGCATCTCAATACCTTACATGA

LOC130996162
ATGTATCTTTATCCATTTATTACTTGTATAGGTGCAAACAGATACTTCTATTTGTGCTTGAATGATTTGATTGCTTTCGGTGGAGGTGCAAGCTTTGCTCTATTATCTGGAACCAGTGGCCCTTGTGAAACATTTGGGAACTCGTGTTTAGCTCATGTTCAAGAGTTTGTATTGAAGGATGTTGAGCTGTGGGGTTTTACGCACGCATCTCAATACCTTACATGA

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777652.1
MYLYPFITCIGANRYFYLCLNDLIAFGGGASFALCLNEDLLSGTSGPCETFGNSCLAHVQEFVLKDVELWGFTHASQYLT

XP_057777653.1
MYLYPFITCIGANRYFYLCLNDLIAFGGGASFALLSGTSGPCETFGNSCLAHVQEFVLKDVELWGFTHASQYLT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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