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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003307`

染色体: Chr07 坐标: 35059088-35062779 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003307`
名称	SmilChr07G003307
描述	protein OBERON 3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	35059088 - 35062779 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996173`
GeneID	`130996173`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996173`
原始查询	`LOC130996173`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein OBERON 3
产物	protein OBERON 3
Arabidopsis	`AT1G14740` (TTA1) class I heat shock protein, putative (DUF1423) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838039] identity=53; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0239200` (TTA) - identity=48.5; qcov=0.774; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF07227 (PHD_Oberon); PF16312 (Oberon_cc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996173

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777665.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777665.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777665.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777665.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777665.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:35059761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr7:35061348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:35061476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:35061654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B8,B91,C25
`Chr7:35061714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:35061721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B136,C86
`Chr7:35061799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr7:35062377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777665.1

820 aa

410

820

PHD_Oberon

Oberon_cc

PF07227 PHD_Oberon 459-583 aa PF16312 Oberon_cc 708-809 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777665.1`	Pfam	`PF07227`	PHD_Oberon	Family	459	583	2.6e-36	125.1	PHD - plant homeodomain finger protein
`XP_057777665.1`	Pfam	`PF16312`	Oberon_cc	Coiled-coil	708	809	4.2e-41	140.6	Coiled-coil region of Oberon

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921682.1
GAAAAAGAATTCAGCCGTTGCAACTTGCCAAATATACAGCGGGGACGAGAGAGAGAGAGCAGTGGAGTCAATGCTCGAAAATTTCAACCAGGCCCTAAGATTCTTTTGAATTTTACAGAATTAGTTTGAGCTCTGTCTCGGTAAGTTATCAGCTCTTTCTCTCTGCTAATTATTTTGCTTTTTCGTTTCTGGTTTTGAGTTGAAGATGGAGAGAGAGCGAGATAATTCGGATGAGTTGTCGGGGGAGAAAAATAGGGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996173
ATGGAGAGAGAGCGAGATAATTCGGATGAGTTGTCGGGGGAGAAAAATAGGGATATCCCGCATGAAAAAAACGAGTTTTTGGAAAAGGGTATTGATTTTCTTAGAGAAAAATCGCAAGATAAAGTTAAATTGATCGGTGGTTTCGATGAAAAGGCTAAACGGGCCGGGAATTTGGGGTCTCAGGAGCTAACTCTTAGCTATCTTTGCGACAATTCGAAACCGTTCTTTGAAAAGGATGTTTCGTTGCTGAATTCTTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777665.1
MERERDNSDELSGEKNRDIPHEKNEFLEKGIDFLREKSQDKVKLIGGFDEKAKRAGNLGSQELTLSYLCDNSKPFFEKDVSLLNSFDKFSGRYKGKEIVVAEDQNEEENNVWVERDFLKLNESRGNSSKREADNDAENREKKPKVESLNLSLALPDVSLSLAGSNRVQNGGDLPSRLRPSRSLQSLGPSYNNNTQTTYSNDFTAASLSYSYSHPHSHNPSCSLTRNSTENYDYSAGSHRRDCDQIWNCGEGTNGSVHSRF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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