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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003306`

染色体: Chr07 坐标: 35057512-35059042 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003306`
名称	SmilChr07G003306
描述	probable transmembrane ascorbate ferrireductase 3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	35057512 - 35059042 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996174`
GeneID	`130996174`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996174`
原始查询	`LOC130996174`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable transmembrane ascorbate ferrireductase 3
产物	probable transmembrane ascorbate ferrireductase 3
Arabidopsis	`AT1G14730` (AT1G14730) Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838038] identity=59.5; qcov=0.956; evalue=7.36e-88; confidence=high
Rice	`Os03g0717200` - identity=45.9; qcov=0.813; evalue=1.9e-46; confidence=medium
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03188 (Cytochrom_B561)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996174

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endosome	内体	1.00000	`XP_057777666.1`
2	Endosome membrane	内体膜	1.00000	`XP_057777666.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057777667.1`
4	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.60000	`XP_057777667.1`
5	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057777666.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:35057711`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C10,C3,C70
`Chr7:35057711`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C10,C3,C70
`Chr7:35057716`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C10,C3,C70
`Chr7:35057716`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C10,C3,C70
`Chr7:35057746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:35057839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B53,B82,B91
`Chr7:35058485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C19,C31
`Chr7:35058561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B53
`Chr7:35058620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777666.1

252 aa

126

252

Cytochrom_B561

PF03188 Cytochrom_B561 58-147 aa PF03188 Cytochrom_B561 156-215 aa

XP_057777667.1

225 aa

112

225

Cytochrom_B561

PF03188 Cytochrom_B561 58-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777666.1`	Pfam	`PF03188`	Cytochrom_B561	Family	58	147	3.5e-33	115.5	Eukaryotic cytochrome b561
`XP_057777666.1`	Pfam	`PF03188`	Cytochrom_B561	Family	156	215	3.5e-33	115.5	Eukaryotic cytochrome b561
`XP_057777667.1`	Pfam	`PF03188`	Cytochrom_B561	Family	58	188	4.6e-37	128.0	Eukaryotic cytochrome b561

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921684.1
CACTTTTTCATATCCCTTGCTAAAGTATAAAGTCTTGTCCCCAAGAAAATATATACGAAACCAGCAACACAAGCAACTTAATTGTCCAAAGTTGATGCTATTTATAACTTGTATTTAGTCCCTATAAATATATAAGTTTAGGTGAGAGAAAGTCACAAATATAGCATCATTGAAAATGGACGTTGAGCATCACAGCCACAGGGGCAGGCATCACAGGTCAGCCTCCGGTCTGACCGTCGTGGCTCACTTCTTTGGCATAC...

XM_057921683.1
CAGCAACACAAGCAACTTAATTGTCCAAAGTTGATGCTATTTATAACTTGTATTTAGTCCCTATAAATATATAAGTTTAGGTGAGAGAAAGTCACAAATATAGCATCATTGAAAATGGACGTTGAGCATCACAGCCACAGGGGCAGGCATCACAGGTCAGCCTCCGGTCTGACCGTCGTGGCTCACTTCTTTGGCATACTCTCCACCATTCTCATGCTCGTCTGGCTGCTCCATTATCGAGAGGGCCTCGACCTCGACTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996174
ATGGACGTTGAGCATCACAGCCACAGGGGCAGGCATCACAGGTCAGCCTCCGGTCTGACCGTCGTGGCTCACTTCTTTGGCATACTCTCCACCATTCTCATGCTCGTCTGGCTGCTCCATTATCGAGAGGGCCTCGACCTCGACTCTGACGACGCCCGTCGCGTCTTCAACGTTCACCCCTTCCTCATGTTTTTTGGCTTCATTTTCATGGCCGGTGAAGCTATGATGGCGTACAAGACTGTGAGAGCAGAGTGGCAAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777666.1
MDVEHHSHRGRHHRSASGLTVVAHFFGILSTILMLVWLLHYREGLDLDSDDARRVFNVHPFLMFFGFIFMAGEAMMAYKTVRAEWQVRKFVHLFFHLVAIVLGIVGLHAAFKYHDQVGLTDMYSLHSWIGMGTFTLYCAQVRLGMYSSSLNFLYRTGAKLVYSFIWQWLLGIAVFLPRSSSESKARIAPWHVNGGRALLFMAVATALTGLMQKATSMRLQHQNEGRLINFLGISILLFGIAVDVSVALARYA

XP_057777667.1
MDVEHHSHRGRHHRSASGLTVVAHFFGILSTILMLVWLLHYREGLDLDSDDARRVFNVHPFLMFFGFIFMAGEAMMAYKTVRAEWQVRKFVHLFFHLVAIVLGIVGLHAAFKYHDQVGLTDMYSLHSWIGMGTFTLYCAQWLLGIAVFLPRSSSESKARIAPWHVNGGRALLFMAVATALTGLMQKATSMRLQHQNEGRLINFLGISILLFGIAVDVSVALARYA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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