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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003328`

染色体: Chr07 坐标: 35532448-35535334 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003328`
名称	SmilChr07G003328
描述	uncharacterized SmilChr07G003328
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	35532448 - 35535334 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996195`
GeneID	`130996195`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996195`
原始查询	`LOC130996195`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0106100; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0106100; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G13200` (EMB2769) Cwf15 / Cwc15 cell cycle control family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820510] identity=76.1; qcov=1.04; evalue=9.57e-99; confidence=high
Rice	`Os06g0106100` - identity=75.7; qcov=1.04; evalue=1.06e-109; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0045292 (mRNA cis splicing, via spliceosome); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04889 (Cwf_Cwc_15)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996195

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777688.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777688.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777688.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777688.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777688.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:35534427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B69,C59
`Chr7:35535008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B61,C31
`Chr7:35535014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr7:35535062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B93,C33,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777688.1

222 aa

111

222

Cwf_Cwc_15

PF04889 Cwf_Cwc_15 1-222 aa

XP_057777689.1

222 aa

111

222

Cwf_Cwc_15

PF04889 Cwf_Cwc_15 1-222 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777688.1`	Pfam	`PF04889`	Cwf_Cwc_15	Family	1	222	6.5e-73	246.3	Cwf15/Cwc15 cell cycle control protein
`XP_057777689.1`	Pfam	`PF04889`	Cwf_Cwc_15	Family	1	222	6.5e-73	246.3	Cwf15/Cwc15 cell cycle control protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921705.1
TAGCTCCCCCATTCTTTTCGAGTTTCGATCCCTCCCCTATCTCTGTGAATCTCGCATTTATTCTCTCTCTCTTCGGCGGCAGCAACAGTCACAGGTAGCCACGGCCGCCGCCGTACACACTACACACCATCATCTCTCTAGCCTGTTACAGTAGCACGGCGCCGCCCTCGGCTCTATTTGCCCCACTGATTTCGCCACCTCATCGGGACCAGTACAACCCTCAAGCCGCCTAAAGAAATTCCCAAATCGAAAGCATCTCC...

XM_057921706.1
ATTACATTATCCGTCTCCCACAGAAATTCCCAAATCGAAAGCATCTCCGATCACCTAGGGTTTTCGATATCTCACTCGCCGACCGATTGTCAAGACTATCAGCTCTTCCAGACTTATTCCTATAGATCGTAGCTCCAGTTTTGAGAATCTCCAGCAAATTAAGGTTCCGTTATGACGACGGCGGCAAGACCTACGTGGGCACCCGCGAAAGGTGGGAATGAACAAGGGGGAACTCGAATCTTCGGTCCATCTCAAAAGTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996195
ATGACGACGGCGGCAAGACCTACGTGGGCACCCGCGAAAGGTGGGAATGAACAAGGGGGAACTCGAATCTTCGGTCCATCTCAAAAGTATTCGTCGAGGGACATCGCTTCTCATACTACCCTCAAACCCAGAAAGGAAGGACAAGACACCCAAGACGAGGTGCAAAGGAGAAATCTCAGGGACGAGCTAGAGGATCGAGAGAGGAGGCATTTCTCATCAAAAGAGGATAGAGATCGCCGGAAAGGAAATCATCTTCTCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777688.1
MTTAARPTWAPAKGGNEQGGTRIFGPSQKYSSRDIASHTTLKPRKEGQDTQDEVQRRNLRDELEDRERRHFSSKEDRDRRKGNHLLLEGSRREVEDRIVPRSIDADDADVDAQSDDDSDDEDDDDDEEALLLELERLRKEKAEQKEREEREKQEEELKAKEEQLLRGNPLLNNPTSFSVKRRWDDDVVFKNQARGETKTPKRFINDTIRNDFHRKFLHKYMK

XP_057777689.1
MTTAARPTWAPAKGGNEQGGTRIFGPSQKYSSRDIASHTTLKPRKEGQDTQDEVQRRNLRDELEDRERRHFSSKEDRDRRKGNHLLLEGSRREVEDRIVPRSIDADDADVDAQSDDDSDDEDDDDDEEALLLELERLRKEKAEQKEREEREKQEEELKAKEEQLLRGNPLLNNPTSFSVKRRWDDDVVFKNQARGETKTPKRFINDTIRNDFHRKFLHKYMK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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