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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003337`

染色体: Chr07 坐标: 35753898-35755452 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003337`
名称	SmilChr07G003337
描述	putative clathrin assembly protein At1g25240
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	35753898 - 35755452 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996202`
GeneID	`130996202`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996202`
原始查询	`LOC130996202`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative clathrin assembly protein At1g25240
产物	putative clathrin assembly protein At1g25240
Arabidopsis	`AT1G25240` (AT1G25240) ENTH/VHS/GAT family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839107] identity=42.2; qcov=1.11; evalue=1.3e-94; confidence=medium
Rice	`Os08g0467300` - identity=37.2; qcov=0.927; evalue=7.1e-54; confidence=medium
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005545 (1-phosphatidylinositol binding); GO:0005546 (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding); GO:0005905 (clathrin-coated pit); GO:0006900 (vesicle budding from membrane); GO:0030136 (clathrin-coated vesicle); GO:0032050 (clathrin heavy chain binding); GO:0048268 (clathrin coat assembly); GO:0072583 (clathrin-dependent endocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF07651 (ANTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996202

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057777695.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057777695.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057777695.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777695.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777695.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:35754236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B131,B37,C14
`Chr7:35754265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B131,B37
`Chr7:35754337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,C2,C35,C39,C40
`Chr7:35754384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C55
`Chr7:35754626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr7:35754687`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B14
`Chr7:35754687`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B14
`Chr7:35754822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C55
`Chr7:35754852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr7:35754958`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B86
`Chr7:35754958`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B86
`Chr7:35754980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777695.1

342 aa

171

342

ANTH

PF07651 ANTH 32-284 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777695.1`	Pfam	`PF07651`	ANTH	Repeat	32	284	6.5e-43	147.4	ANTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921712.1
AACACTTATTAATATTTTATCCCACGTTTTATCCCCTAAATAACACCAATACACGTCTTGGATTAGCAAATCCCATGGCCATGATCTCCACCAAGTCCAAGGACGGCATCTCCCTAACCGCAAAACGCGTCCCCCTCTCCATCTCCCTTGCAATACCATTTGCAATTTACGAACTAAAAGAGAAAAGGAAAAAAAGACAAAGCAATTAAACGAAGATCAAAAGAGATGAAAATACGAGCGCAGGTTTTGTAAATAAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996202
ATGAGGCTATGGAAGCGAGCCTCTGACGCCCTCAAGGACCAGAGCAGCCTCTGGCAGGCGAGCCTGCGTCGGCGCACCGCCCTCCGCAACCCGGACATCGAGAAGGCGGTGATCCGCGCCACCTCCCACCACGACTCGTCCCCCTCCGACCAGCGCAACGTGGAGCGCGTCCGCGAGTGGCTGCGCCTCTCCCCCTCCAACCTCAAGCCCATCCTGCGCTCCCTCTCGGCCCGCATTGAGAAGACCCACAGCTGGCCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777695.1
MRLWKRASDALKDQSSLWQASLRRRTALRNPDIEKAVIRATSHHDSSPSDQRNVERVREWLRLSPSNLKPILRSLSARIEKTHSWPVALKGLLLTHALLNCPAPAPALRAIGRLPFDLSSFRSNSAPFDAFVRAYFAFLDQKSATMFQLSAEEEKYREGFAMRHELLLLQKLQALLDLLVGIKPAPCAAFAPLILDVMDAVVVEIYDVYGRICRGIATVLLNIYSAGKAEAATALRVVHKATQQGDDLAYFFEFCQEIRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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