当前解析结果
SmilChr07G003372| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003372 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003372 |
| 描述 | uncharacterized protein At2g02148-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 36397810 - 36405160 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130996232 |
|---|---|
| GeneID | 130996232 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996232 |
| 原始查询 | LOC130996232 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | PPR containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:10723082]; symbol=AT2G02148; hit=AT2G02148; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | PPR containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:10723082]; symbol=AT2G02148; hit=AT2G02148; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G02148 (AT2G02148)PPR containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:10723082] identity=55.7; qcov=0.98; evalue=8.61e-138; confidence=high |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996232 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057777725.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057777725.1 |
| 3 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057777724.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777725.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777725.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:36398122 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C86 |
Chr7:36399617 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B66,C53,C78 |
Chr7:36399689 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C31 |
Chr7:36403542 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C43 |
Chr7:36403832 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr7:36404068 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B64 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。