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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003769`

染色体: Chr01 坐标: 56050375-56052368 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003769`
名称	SmilChr01G003769
描述	polygalacturonase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56050375 - 56052368 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996237`
GeneID	`130996237`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996237`
原始查询	`LOC130996237`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase-like
产物	polygalacturonase-like
Arabidopsis	`AT3G59850` (AT3G59850) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825155] identity=64.3; qcov=0.924; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0623600` (OsPGL32) - identity=51.7; qcov=1.02; evalue=9.35e-149; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28); PF12708 (Pect-lyase_RHGA_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996237

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057777730.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057777730.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777730.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777730.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777730.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56050661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:56050696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C56,C59,C84
`Chr1:56050723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:56050798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:56050967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:56051559`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A20,B128,B15
`Chr1:56051559`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A20,B128,B15
`Chr1:56051564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B4,B85
`Chr1:56051571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B4,B85
`Chr1:56051625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:56051672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr1:56051934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777730.1

397 aa

198

397

Pect-lyase_RHGA_epim

Glyco_hydro_28

PF12708 Pect-lyase_RHGA_epim 33-282 aa PF00295 Glyco_hydro_28 59-384 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777730.1`	Pfam	`PF12708`	Pect-lyase_RHGA_epim	Repeat	33	282	8.1e-14	52.6	Rhamnogalacturonase A/epimerase, pectate lyase-like
`XP_057777730.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	59	384	2.3e-87	293.9	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921747.1
AGTTTCAAATCACCCACAAAAACACACACACTACCACAACAAATGGCCACCTCAAGAATGATCCAAATTCTCATTTTGTCACTTTATTACTACCACTCTTCATCAATATCCGTACTTGCAGCCAATAATCCCACCTACAATGTGCAGTCCTACGGCGCGAAATCCGATGGAAAATCCGATTGCACCAAGGCATTTCTGAGCGCTTGGGGGGCGGCGTGCGCCACCACGGCCCCGGCCACCATATATGTCCCGCCGGGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996237
ATGGCCACCTCAAGAATGATCCAAATTCTCATTTTGTCACTTTATTACTACCACTCTTCATCAATATCCGTACTTGCAGCCAATAATCCCACCTACAATGTGCAGTCCTACGGCGCGAAATCCGATGGAAAATCCGATTGCACCAAGGCATTTCTGAGCGCTTGGGGGGCGGCGTGCGCCACCACGGCCCCGGCCACCATATATGTCCCGCCGGGGAGGTACCTCTTGCGAAACGCATATTTTAGTGGCAGTTTGTGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777730.1
MATSRMIQILILSLYYYHSSSISVLAANNPTYNVQSYGAKSDGKSDCTKAFLSAWGAACATTAPATIYVPPGRYLLRNAYFSGSLCKNTAITIRIDGTLVAPSDYNAIGNSGNWLKFERITGVSIYGGTLDGQGANLWACKNSGKSCPKGATSLAFYNSNNIRINGLVSVNSQMFHILIDGCRNANLVNVRVSAPGNSPNTDGIHVQQSSGVTIMNSHVATGDDCVSIGPGASNLWIENLACGPGHGISIGSLGWDMNEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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