当前解析结果
SmilChr07G003413| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003413 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003413 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003413 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 37165794 - 37168257 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130996242 |
|---|---|
| GeneID | 130996242 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996242 |
| 原始查询 | LOC130996242 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996242 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057777735.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057777737.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777735.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777735.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057777735.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:37166225 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B33,B40,B44,C63 |
Chr7:37166251 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B56,B96,C65 |
Chr7:37166261 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B85 |
Chr7:37166273 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B85 |
Chr7:37166292 |
CTA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 87 | A1,A10,A13,A14,A19,A20,A24,A6,A7,A9,B100,B101,B102,B104,B106,B109,B11,B112,B113,B114,B118,B119,B125,B127,B129,B13,B131,B2,B21,B22,B23,B24,B28,B3,B31,B35,B38,B39,B40,B41,B45,B48,B5,B53,B58,B61,B63,B66,B70,B71,B80,B82,B86,B88,B91,B92,B93,B94,B96,C16,C19,C24,C32,C33,C34,C35,C36,C39,C4,C40,C48,C54,C56,C6,C60,C61,C65,C68,C75,C77,C9,D1,D2,D3,D4,D5,D8 |
Chr7:37166323 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 36 | A15,A23,A6,B100,B102,B103,B13,B136,B139,B38,B39,B4,B41,B46,B49,B5,B51,B52,B54,B63,B7,B79,B86,C17,C18,C25,C27,C28,C36,C43,C49,C55,C64,C66,C7,C76 |
Chr7:37166342 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A5,B106,B2,B8,C58,C62,C78 |
Chr7:37166343 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,B13,B24 |
Chr7:37166350 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B119,B3,C24,D4 |
Chr7:37166351 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B109,B33,B40,B44,C63 |
Chr7:37166358 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | A24,B108,B119,B135,B138,B31,B94,C80,C87 |
Chr7:37166486 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B88 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。