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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002030`

染色体: Chr07 坐标: 18341761-18345562 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002030`
名称	SmilChr07G002030
描述	protein TIFY 9-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	18341761 - 18345562 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996251`
GeneID	`130996251`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996251`
原始查询	`LOC130996251`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIFY 9-like
产物	protein TIFY 9-like
Arabidopsis	`AT5G13220` (JAZ10) jasmonate-zim-domain protein 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831162] identity=45.8; qcov=1.06; evalue=1.94e-42; confidence=medium
Rice	`Os04g0395800` (OsJAZ11) - identity=45.1; qcov=0.458; evalue=1.11e-14; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009611 (response to wounding); GO:0031347 (regulation of defense response); GO:2000022 (regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06200 (tify); PF09425 (Jas_motif)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996251

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777740.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057777740.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777740.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777740.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777740.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:18342020`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A4,B101,B127,B14,B19,B4,B44,B46,B57,B69,B79,B81,B97,C21,C35,C50,C51,C52,C70,C81,C87,C9,D6
`Chr7:18342286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B60,B7,B9,C15,C66
`Chr7:18342630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777740.1

181 aa

181

tify

Jas_motif

PF06200 tify 94-124 aa PF09425 Jas_motif 155-173 aa

XP_057777741.1

179 aa

179

tify

Jas_motif

PF06200 tify 94-124 aa PF09425 Jas_motif 155-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777740.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	94	124	7.7e-12	45.0	tify domain
`XP_057777740.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	155	173	8.6e-10	38.9	Jas motif
`XP_057777741.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	94	124	7.5e-12	45.1	tify domain
`XP_057777741.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	155	179	1.6e-13	50.8	Jas motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921758.1
GAAATCTCATTTTCCTCGTGCCCTTCATTTAATAGTGTAGAGAGAGAGTATTCAATATTCTGGCCGACCGTCTCAAATATCAATACATCTTTATATATATAAATATGGATATGAACATCTAAAGCATACACCATTATATGAATGAATCACTATCTCATCACCTCTCCTTGTCCTCATCTCCTCTCTCTATCGCATCTAAATCAAACGTGACTCACACCCAAAATTGAAGCCATGGCCAAATCTTCATCTCTCGAGCTTGA...

XM_057921757.1
AATATTCTGGCCGACCGTCTCAAATATCAATACATCTTTATATATATAAATATGGATATGAACATCTAAAGCATACACCATTATATGAATGAATCACTATCTCATCACCTCTCCTTGTCCTCATCTCCTCTCTCTATCGCATCTAAATCAAACGTGACTCACACCCAAAATTGAAGCCATGGCCAAATCTTCATCTCTCGAGCTTGATTTTTTCGGCATGGAGAAAGGATCTACTGTCCTCCCTCCTCCGACTGCGGCCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996251
ATGGCCAAATCTTCATCTCTCGAGCTTGATTTTTTCGGCATGGAGAAAGGATCTACTGTCCTCCCTCCTCCGACTGCGGCCCCCGTTTTTCAGCGCAGACGCAGTTTTCGCGATATGCAAGGTGTTATAACGAAGATGAATCCGGAGGTGGTGAAGAGCGTGATTGGGAATGGCGGTTTGGGATCGAAGAGATCATCAGCTGTTGCAGTTCCTTCTCCCCAATCGCCACTTTGCGATCCGAAACTTAGCCTGCGGTGTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777740.1
MAKSSSLELDFFGMEKGSTVLPPPTAAPVFQRRRSFRDMQGVITKMNPEVVKSVIGNGGLGSKRSSAVAVPSPQSPLCDPKLSLRCGGDYENAENTAPMTIFYNGVVSVFDVSARKAQDILKVADEILPPKSAENLESNSHTERNLLESLNGDLPISRKNSLQRFLEKRKERVDINEDVIT

XP_057777741.1
MAKSSSLELDFFGMEKGSTVLPPPTAAPVFQRRRSFRDMQGVITKMNPEVVKSVIGNGGLGSKRSSAVAVPSPQSPLCDPKLSLRCGGDYENAENTAPMTIFYNGVVSVFDVSARKAQDILKVADEILPPKSAENLESNSHTERNLLESLNGDLPISRKNSLQRFLEKRKERLITVSPY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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