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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003401`

染色体: Chr07 坐标: 36915024-36918027 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003401`
名称	SmilChr07G003401
描述	uncharacterized SmilChr07G003401
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	36915024 - 36918027 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996291`
GeneID	`130996291`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996291`
原始查询	`LOC130996291`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0491900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os10g0491900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G02160` (AT2G02160) CCCH-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814747] identity=53.2; qcov=0.468; evalue=7.61e-30; confidence=medium
Rice	`Os10g0491900` - identity=57.3; qcov=0.472; evalue=1.86e-32; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF01585 (G-patch); PF12656 (G-patch_2); PF14608 (zf-CCCH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996291

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777781.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057777781.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057777781.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777781.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777781.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:36915310`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	32	A19,A22,A5,B114,B117,B120,B121,B122,B135,B140,B17,B33,B35,B42,B43,B44,B46,B48,B55,B58,B62,B66,B67,B76,B81,C1,C2,C23,C37,C45,C48,C9
`Chr7:36915634`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	59	A1,A10,A20,A22,A9,B1,B102,B110,B111,B114,B115,B117,B118,B12,B120,B128,B135,B140,B15,B16,B24,B26,B28,B3,B35,B36,B43,B44,B48,B49,B59,B60,B7,B75,B81,B85,B86,B9,B94,B95,C18,C30,C40,C44,C45,C46,C55,C59,C70,C72,C75,C81,C84,C86,C9,D3,D5,D8,D9
`Chr7:36916259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B31,C80,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777781.1

233 aa

116

233

G-patch_2

G-patch

zf-CCCH_2

PF12656 G-patch_2 24-74 aa PF01585 G-patch 30-73 aa PF14608 zf-CCCH_2 149-167 aa PF14608 zf-CCCH_2 190-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777781.1`	Pfam	`PF12656`	G-patch_2	Domain	24	74	2.3e-06	28.2	G-patch domain
`XP_057777781.1`	Pfam	`PF01585`	G-patch	Family	30	73	1.2e-18	67.5	G-patch domain
`XP_057777781.1`	Pfam	`PF14608`	zf-CCCH_2	Domain	149	167	2e-08	35.1	RNA-binding, Nab2-type zinc finger
`XP_057777781.1`	Pfam	`PF14608`	zf-CCCH_2	Domain	190	210	2e-08	35.1	RNA-binding, Nab2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921798.1
ATTAATCTTCCCTCAAAAAGAAATATATATATAATATTAATCCATTAATGGGCTAAACTGTCCATCGTTGCATGTCTTGTAAAATTAAACAGGTTTTGTTTTTCCTCTCACTTTATTAATTGATTTTTCTTTCGTTTAATTAATGTGGGTTTTTCTACGCAACGGTAATGGCGGTTGATGATGATTCTTCAGCGGGTTTGGAAACGACTAGGGCTTCGCATCTAAGCACTTCTGCTTCCACCCCGATAGATTCATCGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996291
ATGGCGGTTGATGATGATTCTTCAGCGGGTTTGGAAACGACTAGGGCTTCGCATCTAAGCACTTCTGCTTCCACCCCGATAGATTCATCGAATATTGGTTTTCAGTTGTTAAAGAAGCAAGGATGGAAAGAAGGAACTGGCCTTGGTGCTTCCGAACAGGGCAGGCTGGAGCCAATAGCAACTATTGTCAAGAAAAATAAAAGAGGTTTGGGAGCAGAAAAGGCATATAAGGAAATCAAGCAATCCAAAGACAAGGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777781.1
MAVDDDSSAGLETTRASHLSTSASTPIDSSNIGFQLLKKQGWKEGTGLGASEQGRLEPIATIVKKNKRGLGAEKAYKEIKQSKDKDKGDPKLPKIKVKGVSKKMRKIQKLEKKMQEKEFDRDFFRMFWPDNGSECEYRHSDIARVNQRDCWYWLHGSCLNPKCAFRHRPLEELGGPASNVPNAFTKPAVACVFFQKGHCLKGDWCPFLHAPNTKAIPVPVTVRPWHIYVREEF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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