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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003405`

染色体: Chr07 坐标: 36964204-36971455 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003405`
名称	SmilChr07G003405
描述	uncharacterized SmilChr07G003405
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	36964204 - 36971455 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996295`
GeneID	`130996295`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996295`
原始查询	`LOC130996295`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT1G60670; symbol=AT1G60670; hit=AT1G60670; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	AT1G60670; symbol=AT1G60670; hit=AT1G60670; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G60670` (AT1G60670) - identity=43.5; qcov=0.827; evalue=4.32e-58; confidence=medium
Rice	`Os02g0631200` (B1250G12.9-1) - identity=44.5; qcov=0.73; evalue=4.52e-51; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12579 (DUF3755)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996295

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777786.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777786.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777786.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777786.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777786.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:36965356`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A19,A2,A24,B108,B119,B122,B138,B31,B52,B81,B86,C80,C87
`Chr7:36965401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:36965452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr7:36965626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,D6
`Chr7:36969879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777786.1

296 aa

148

296

DUF3755

PF12579 DUF3755 216-248 aa

XP_057777787.1

296 aa

148

296

DUF3755

PF12579 DUF3755 216-248 aa

XP_057777788.1

289 aa

144

289

DUF3755

PF12579 DUF3755 216-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777786.1`	Pfam	`PF12579`	DUF3755	Family	216	248	9e-14	51.5	Protein of unknown function (DUF3755)
`XP_057777787.1`	Pfam	`PF12579`	DUF3755	Family	216	248	9e-14	51.5	Protein of unknown function (DUF3755)
`XP_057777788.1`	Pfam	`PF12579`	DUF3755	Family	216	248	8e-14	51.7	Protein of unknown function (DUF3755)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921805.1
AGAAAATGAAAAAAGAAGAGAAAGAAACAAAAACAGCAACAACGAAAAACCTCTCCCACTTCACAAAGCAAAAAGAAATAGCAGCAGCAGTATCTGCTTATAATTTAGTGCAAACAGTTGTCAATTATTTCTCTCTCTCCAAATTTGGAAAATTCCTCTTGGATTCTTCGCACCAAAAAAATCTGGAGCAACCCCACGTAGCTGAAACAATTCGCACAAACGAATGACAAGCGAGTCGAGCGCCGGGTTCCACCACCACC...

XM_057921803.1
AGAAACAAAAACAGCAACAACGAAAAACCTCTCCCACTTCACAAAGCAAAAAGAAATAGCAGCAGCAGTATCTGCTTATAATTTAGTGCAAACAGTTGTCAATTATTTCTCTCTCTCCAAATTTGGAAAATTCCTCTTGGATTCTTCGCACCAAAAAAATCTGGAGCAACCCCACGGTAATGTGAGCAAATTGCAGGCTCGCTGCAGCAGATGTTCTTCCCAAAATTTAAGGTGCGCTCCAATTTTTTTTTAATGCAGTA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130996295
ATGACAAGCGAGTCGAGCGCCGGGTTCCACCACCACCACCACGCCGGATTGTTCACACCCGGTGGAACAACGAGCAGCAGCAGCAGCGGCGGCAGTGGAAACTATACTTACGGCGGAGGAAGCATGAATTTGGGCGGAAATGAATGCCCTAGCGGAAGAATGCTCTTTGGTGCGCAGAATTCTCTTGATTCTTCGTTGACGCATGTGCTGGATTCGTTTCCCGGGTTGAAGCACGACGGCGGTTTCGCGGTCGAGTGGTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057777786.1
MTSESSAGFHHHHHAGLFTPGGTTSSSSSGGSGNYTYGGGSMNLGGNECPSGRMLFGAQNSLDSSLTHVLDSFPGLKHDGGFAVEWLIDEQYKLEEGLAKYASEPNIIKYVKIAASLRDKTVRDVALRCRWMMRKRRKQEHPCFGKKVKDRKEKMVEPALKTNMPSASSVNVGPYSSTTKQQCGYMITGVLSGMTRHLLEENSRSFEQISVNLSTHKLQQNIDLFFHVRNNIITVLDSMTKMPGIMSQMPPLPVLLNEEL...

XP_057777787.1
MTSESSAGFHHHHHAGLFTPGGTTSSSSSGGSGNYTYGGGSMNLGGNECPSGRMLFGAQNSLDSSLTHVLDSFPGLKHDGGFAVEWLIDEQYKLEEGLAKYASEPNIIKYVKIAASLRDKTVRDVALRCRWMMRKRRKQEHPCFGKKVKDRKEKMVEPALKTNMPSASSVNVGPYSSTTKQQCGYMITGVLSGMTRHLLEENSRSFEQISVNLSTHKLQQNIDLFFHVRNNIITVLDSMTKMPGIMSQMPPLPVLLNEEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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