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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003406`

染色体: Chr07 坐标: 36991092-36994984 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003406`
名称	SmilChr07G003406
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 17
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	36991092 - 36994984 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996296`
GeneID	`130996296`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996296`
原始查询	`LOC130996296`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 17
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 17
Arabidopsis	`AT2G02160` (AT2G02160) CCCH-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814747] identity=40.6; qcov=0.874; evalue=4.03e-102; confidence=medium
Rice	`Os04g0671800` (OsC3H32) - identity=30.6; qcov=1.09; evalue=9.18e-67; confidence=low
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14608 (zf-CCCH_2); PF15663 (zf-CCCH_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996296

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777789.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777789.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777789.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777789.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777789.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:36991706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:36992028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B101,B132,B91,C35
`Chr7:36992498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B77,C46
`Chr7:36992784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,C25,C38,C50
`Chr7:36992936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr7:36993131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B29,B71,C6
`Chr7:36993188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C43
`Chr7:36993506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:36993534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B101,B132,B91,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777789.1

704 aa

352

704

zf-CCCH_3

zf-CCCH_2

PF15663 zf-CCCH_3 23-77 aa PF14608 zf-CCCH_2 27-48 aa PF14608 zf-CCCH_2 58-77 aa PF14608 zf-CCCH_2 118-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777789.1`	Pfam	`PF15663`	zf-CCCH_3	Family	23	77	8.1e-15	55.7	Zinc-finger containing family
`XP_057777789.1`	Pfam	`PF14608`	zf-CCCH_2	Domain	27	48	1.8e-11	44.8	RNA-binding, Nab2-type zinc finger
`XP_057777789.1`	Pfam	`PF14608`	zf-CCCH_2	Domain	58	77	1.8e-11	44.8	RNA-binding, Nab2-type zinc finger
`XP_057777789.1`	Pfam	`PF14608`	zf-CCCH_2	Domain	118	138	1.8e-11	44.8	RNA-binding, Nab2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921806.1
AGCAGATCTGATATTATATAGTACACACACTCATCTATTTTATTTTTTCTCTCGCTGGTTCTCATCGTCTCTCTTCTCGCTCTCTCTCATCCTAGCTCACTTTCTCTATCCTCTCGCTCTCTGGCGCTCGCAGCGCAATCGTTCTCGGAGGTTGTATTTGATGCCGCAAAAGGGGGAGAAACAGTGTTAGGAGGAAACCTACCTGAGAGCAGCCGCCTCAATTAATTAAAACCCTAGATCCATAGATAAACATTTAAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996296
ATGGCGACTTCTGCGCCTCAATCTCAATCTCAATCTCAGCCTCCCTCCGCTGAGGAAGAAGTGCTCAAGAGGAACACCGATTGTGTTTACTTTCTTGCTTCGCCTTTAACTTGCAAAAAGGGAAGCGAATGTGAGTATCGCCATAGTGAGATCGCACGGGTAAATCCAAGGGACTGTTGGTACTGGTTACATGGTAACTGCTTGAATCCGAAGTGTGCCTTCCGTCATCCGCCGCTTGAAGGGTTGCTCGGAACCCAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777789.1
MATSAPQSQSQSQPPSAEEEVLKRNTDCVYFLASPLTCKKGSECEYRHSEIARVNPRDCWYWLHGNCLNPKCAFRHPPLEGLLGTQVPTSTGPSAPVPQAVTGPASHVPNAFTKPAVACVFFQKGHCLKGDWCPFLHAPNASNTKAIPVPVTVSAVEPANINKPSSGVEKPLQQKVTPINVAKSLNDTARSKPLAAVESTAPRYESAVSRKVPQTSGSNVFSGYRAATPISNGHPVSWSSRAQQSHLFDEPESMNNKDAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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