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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003452`

染色体: Chr08 坐标: 36999044-37002717 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003452`
名称	SmilChr08G003452
描述	uridine nucleosidase 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	36999044 - 37002717 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996582`
GeneID	`130996582`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996582`
原始查询	`LOC130996582`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uridine nucleosidase 1
产物	uridine nucleosidase 1
Arabidopsis	`AT2G36310` (URH1) uridine-ribohydrolase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818204] identity=78.2; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0557900` - identity=73.1; qcov=0.943; evalue=3.57e-178; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0006152 (purine nucleoside catabolic process); GO:0008477 (purine nucleosidase activity)
KEGG	smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00760 (Nicotinate and nicotinamide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01156 (IU_nuc_hydro)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996582

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777858.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777858.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777858.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777858.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777858.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:36999397`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B12
`Chr8:36999621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr8:36999627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C20
`Chr8:37001142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr8:37002342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777858.1

335 aa

168

335

IU_nuc_hydro

PF01156 IU_nuc_hydro 23-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777858.1`	Pfam	`PF01156`	IU_nuc_hydro	Domain	23	324	2e-90	304.2	Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921875.1
ATAATAAAGAAAAAGGAGTCTTTGTCTTTGTATAATGCATTATGCATCACAAAGCAAAGCACGATCGGATTGGAGTTGGAAGGAAGAGGCGTTACGAATAATGATTCCATTTTAATTGCCATTTTTTTGCATATTCCTTCGATTTAATAAACGGAAAGGGGACAGTCTCAGAATCACAGCTGACTGTGCAACTCCGCATTTATCTTTCATTTTTAAATTAGGAGATGCTCCAACTCTGTGCGCTTATATATATCTGTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996582
ATGTCGAGCGACGGGATTGATGGCGTCGTGGTTTCGGGAAATTGTTGTTCGAAGAAACGTGAGAAGGTTATTATTGACACCGATCCCGGCATTGATGATAGCATGGCAATACTAATGGCATTTCAGTCACCTGAATTGGATATATTGGGATTAACAACAGTATTTGGCAATGTCAATACAGAGGATGCGACAAATAATGCATTGCTTCTGTGTGAGATTGCTGGACGTCCAGATGTTCCAGTTGGAGGTAGTTTTGAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777858.1
MSSDGIDGVVVSGNCCSKKREKVIIDTDPGIDDSMAILMAFQSPELDILGLTTVFGNVNTEDATNNALLLCEIAGRPDVPVAXGSFEPLKRGKPRIADFVHGSDGLGNISLDPPKSGKCDKSAPEFLVDKVSEDPGEVSILALGPLTNIALAIKRDSSFASKIKRLVILGGAFFALGNVNPXAEANIYGDPEAADVVFTSGANIDVVGINITTQVKLTDMHLEELRKSSGRHAQLLCDMCKFYRDWHVKSDGVYGIFLHD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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