Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003453`

染色体: Chr08 坐标: 37010168-37012504 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003453`
名称	SmilChr08G003453
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 12-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37010168 - 37012504 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996583`
GeneID	`130996583`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996583`
原始查询	`LOC130996583`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 12-like
产物	transcription initiation factor TFIID subunit 12-like
Arabidopsis	`AT3G10070` (TAF12) TBP-associated factor 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820168] identity=42.2; qcov=0.853; evalue=4.73e-10; confidence=low
Rice	`Os01g0858500` - identity=67.7; qcov=0.453; evalue=4.94e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996583

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777859.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057777859.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057777859.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777859.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777859.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092682.1
TGAAAATTTTGGGGTTGTTTGCTAATGTCTAACAGAATGCATAAGAGGGAGCCCAGTCTCGTCATCTCATCATCTAATGGCAAGGGTTTGTTCACTTTGTGGTCTTATCTGTTTTTACTGCTCAAGAAATATGTTCCATATATCTTCTTATGACACAATTTGTGAATCATTGCGTAATTTTGTATAATTTAGATTGCTCTCATTCCTTTTTCCACTGTTAATTTGTTTTTCATTTTTCTTAAATATTACGTACCAGATTA...

XM_057921876.1
TCTTATCTGTTTTTACTGCTCAAGAAATATGTTCCATATATCTTCTTATGACACAATTTGTGAATCATTGCGTAATTTTGTATAATTTAGATTGCTCTCATTCCTTTTTCCACTGTTAATTTGTTTTTCATTTTTCTTAAATATTACGTACCAGATTACAACATTTGGATGTTCGTTGGCCAAGCACCGAAAGTCTTCCACTTTAGAAGCGAAAGACATACTCCTGCATCTTGAAAGAAATTGGAATATGGCTCTTCCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996583
ATGGCTCTTCCTGGGTTTGGTGGAGATGAGATAAGGATTTTCAAGAAACCGCATGTCAATGAGCTTCACAGGGAGCGGCTTGCTGCTGTAAAAAAGTCAATGTTAGCTTCTGATACTATCAGTAAGAACTCCAGCGGAGCATCTGGGAGTGCTAAGGGTCATCTGGCAAAAGGACCTGCCAATACCATCAGTTCTCCCCCAAATTCTAAAATACGTGAAGCTGCATGA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777859.1
MALPGFGGDEIRIFKKPHVNELHRERLAAVKKSMLASDTISKNSSGASGSAKGHLAKGPANTISSPPNSKIREAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器