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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003454`

染色体: Chr08 坐标: 37040282-37043277 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003454`
名称	SmilChr08G003454
描述	uncharacterized SmilChr08G003454
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37040282 - 37043277 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996584`
GeneID	`130996584`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996584`
原始查询	`LOC130996584`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=33.9; qcov=0.929; evalue=4.13e-45; confidence=low
Rice	`Os11g0577650` - identity=48.3; qcov=0.79; evalue=3.65e-67; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996584

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777860.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057777860.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057777860.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777860.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777860.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37041252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B22,C24,C25,C74
`Chr8:37041307`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	A14,A16,B114,B124,B128,B133,B134,B49,B56,B58,B62,B96,C13,C25,C36,C38,C56,C59,C63,C65,C70,C74,C8,C9,D8
`Chr8:37041310`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A14,A16,B114,B124,B128,B133,B134,B49,B56,B58,B62,B96,C13,C25,C36,C38,C56,C59,C63,C65,C70,C74,C8,C9,D8
`Chr8:37041338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B21,C28,C65
`Chr8:37041346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B21,C28,C65
`Chr8:37041357`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B135,C58
`Chr8:37041357`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B135,C58
`Chr8:37041359`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B135,C58
`Chr8:37041359`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B135,C58
`Chr8:37041384`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A14,A16,B1,B114,B32,B49,B56,B58,B59,B74,B75,C25,C36,C56,C63,C8,C9
`Chr8:37041387`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A14,A16,B1,B114,B32,B49,B56,B58,B59,B74,B75,C25,C36,C56,C63,C8,C9
`Chr8:37041407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B117,C28,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777860.1

267 aa

134

267

DUF8040

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 14-98 aa PF13359 DDE_Tnp_4 130-246 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777860.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	14	98	5e-21	75.1	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057777860.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	130	246	1.3e-11	45.1	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092683.1
AGAAAAGCCCAAGCCCGGTCAAAATTCACTGTTTCACATGTAATACTCATCGGTGCCCCCCCTTCCGATACGGTTCGGAAATCAAAAGTGAATTTCAAAATTGCCTCAATTACCCTTTCAATTTTTCATTCAAATCTTCCAAAAGAAATTCAAGCGCCCATTCTTCGTCTGCCTCGGCTGAAAATCGCGTAACCTAGCGAATAGCGAAGAAGGGTCACCCGGCGACCGTTGCAGCGAAGCTGGTTTCCTTCGCTCTTGGA...

XR_009092684.1
AGAAAAGCCCAAGCCCGGTCAAAATTCACTGTTTCACATGTAATACTCATCGGTGCCCCCCCTTCCGATACGGTTCGGAAATCAAAAGTGAATTTCAAAATTGCCTCAATTACCCTTTCAATTTTTCATTCAAATCTTCCAAAAGAAATTCAAGCGCCCATTCTTCGTCTGCCTCGGCTGAAAATCGCGTAACCTAGCGAATAGCGAAGAAGGGTCACCCGGCGACCGTTGCAGCGAAGCTGGTTTCCTTCGCTCTTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996584
ATGATAACTCGAATCCCGGATCAGGTGAAGCACTTAGGGAGGCTAATTAGTGCTAACGATATAGATTGTATCGTAAACCTCCGTATGGACCGTAATGCTTTCGGTCGGCTGTGTCAAATACTCAGGGATATGGGGGGATTAGTCAATGGTCGCCACGTTAGTGTGGAAGAACAAGTTGTTATGTTCGTCTCGGTCCTAGCCCATCACAAAAAGAACAGAATAGTAGGATTTGATTTTTGGCGGTCTGGACAAACAATATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777860.1
MITRIPDQVKHLGRLISANDIDCIVNLRMDRNAFGRLCQILRDMGGLVNGRHVSVEEQVVMFVSVLAHHKKNRIVGFDFWRSGQTILHYVHVVLGAILRLHETFLAKPDVVTDDCTDSRWQWFKGCLGALDGTYVNVLVSNTDKPRYRTRKGEISTNVLAVCDRKLQFVYALCGWEGSASDCRILRDSLTRPHGLKVPKGKYYLCDNGYANSDGFLTPFKGVRYHLKEWGPLAGRPQNKEELFNLRHRWLVRQRDQRPPQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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