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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003457`

染色体: Chr08 坐标: 37054589-37056545 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003457`
名称	SmilChr08G003457
描述	tyrosine-protein phosphatase RLPH2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37054589 - 37056545 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996586`
GeneID	`130996586`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996586`
原始查询	`LOC130996586`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tyrosine-protein phosphatase RLPH2-like
产物	tyrosine-protein phosphatase RLPH2-like
Arabidopsis	`AT3G09970` (AT3G09970) Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820158] identity=66.7; qcov=0.872; evalue=1.15e-155; confidence=high
Rice	`Os04g0409500` - identity=62.9; qcov=0.875; evalue=6.38e-145; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00149 (Metallophos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996586

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777864.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777864.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057777864.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777864.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777864.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37054925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:37055214`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C1
`Chr8:37055214`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr8:37056075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:37056185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:37056269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:37056465`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B108,B2,B56,B96,D4
`Chr8:37056465`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B108,B2,B56,B96,D4
`Chr8:37056487`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	B128,B68,B82,B98,C23,C48,C50,C52,C7,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777864.1

351 aa

176

351

Metallophos

PF00149 Metallophos 48-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777864.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	48	256	3.2e-14	54.6	Calcineurin-like phosphoesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921881.1
TGACTTATAAATGATCCCCTCTTTGGATGAGTTAGTAAGTGATTCACGTGGATGCTCTAAGAGCCTCCATTTTTTTGAAAGTGGTAATTGTGTGTTGAAACTTGAAGGCCACTTCTTCATCTCATCAATGGCTACAAGTAAAGCGAGAATGGTTTGCTGCGTAGGCGACATCCACGGTTACATAAGAAAACTGCAAAACTTGTGGTCTAACCTCGAAAAAGCACTACCCCCCTCTGATTTCCAATCTGCCCTAATTATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996586
ATGATCCCCTCTTTGGATGAGTTAGTAAGTGATTCACGTGGATGCTCTAAGAGCCTCCATTTTTTTGAAAGTGGTAATTGTGTGTTGAAACTTGAAGGCCACTTCTTCATCTCATCAATGGCTACAAGTAAAGCGAGAATGGTTTGCTGCGTAGGCGACATCCACGGTTACATAAGAAAACTGCAAAACTTGTGGTCTAACCTCGAAAAAGCACTACCCCCCTCTGATTTCCAATCTGCCCTAATTATATTCCTGGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777864.1
MIPSLDELVSDSRGCSKSLHFFESGNCVLKLEGHFFISSMATSKARMVCCVGDIHGYIRKLQNLWSNLEKALPPSDFQSALIIFLGDYCDRGPNTKEVIDFLISLPSNYPNQRHVFLCGNHDLAFAAFLGLLPSPVDGSDFSATWEEYAMNEERERWYKGEGYENMHLQGRRWAGRMIGFNRAKNTDYQGSIYDAAPTFQSYGVPHGSAELRKAVPDEHKKFLADLVWVHEEDNVSIETEKGVQNCKLIAVHAGLEKGKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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