当前解析结果
SmilChr08G003463| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003463 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003463 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003463 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 37231026 - 37232293 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130996588 |
|---|---|
| GeneID | 130996588 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996588 |
| 原始查询 | LOC130996588 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0186600; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os06g0186600; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0186600- identity=43.6; qcov=0.969; evalue=6.62e-25; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996588 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057777865.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057777865.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057777865.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777865.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777865.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:37231286 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B127,B62,D8 |
Chr8:37231298 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,C51,D11 |
Chr8:37231338 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B127,B62,D8 |
Chr8:37231422 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A20,D11 |
Chr8:37231422 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | A20,D11 |
Chr8:37231472 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,C51,D11 |
Chr8:37231474 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | A8,B127,B62,D8 |
Chr8:37231474 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B127,B62,D8 |
Chr8:37231617 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B1,B2 |
Chr8:37231617 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B1,B2 |
Chr8:37231635 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B127,B62,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。