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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003464`

染色体: Chr08 坐标: 37236362-37237661 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003464`
名称	SmilChr08G003464
描述	protein LITTLE ZIPPER 3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37236362 - 37237661 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996589`
GeneID	`130996589`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996589`
原始查询	`LOC130996589`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LITTLE ZIPPER 3
产物	protein LITTLE ZIPPER 3
Arabidopsis	`AT3G52770` (ZPR3) binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824443] identity=80; qcov=0.592; evalue=2.92e-20; confidence=low
Rice	`Os04g0411200` - identity=51.6; qcov=1.25; evalue=9.06e-23; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30681 (ZPR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996589

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777868.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777866.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057777866.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057777869.1`
5	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057777869.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37236535`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	156	A10,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A20,A23,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B100,B101,B102,B105,B106,B107,B111,B112,B114,B115,B119,B12,B120,B123,B126,B129,B13,B130,B132,B134,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B2,B21,B22,B25,B26,B27,B29,B3,B31,B32,B35,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B47,B48,B5,B50,B51,B53,B54,B56,B57,B58,B59,B62,B63,B64,B65,B67,B69,B71,B72,B73,B75,B78,B79,B8,B81,B83,B87,B89,B91,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C12,C13,C14,C15,C16,C19,C2,C20,C22,C23,C24,C27,C28,C29,C3,C31,C32,C34,C35,C36,C4,C42,C45,C46,C47,C48,C49,C51,C54,C56,C57,C58,C6,C60,C61,C64,C65,C66,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C82,C84,C85,C86,C87,D10,D11,D2,D6,D8,D9
`Chr8:37236824`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A21,B101,B109,B110,B111,B114,B122,B127,B131,B28,B40,B54,B62,B77,B82,B91,C14,C22,C25,C4,C43,C73,C8,D7
`Chr8:37237357`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A20,B118,B140,B68,B80,C17,D7,D9
`Chr8:37237379`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A20,B118,B140,B68,B80,C17,D7,D9
`Chr8:37237381`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A20,B118,B140,B68,B80,C17,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777866.1

151 aa

151

ZPR

PF30681 ZPR 73-118 aa

XP_057777868.1

110 aa

110

ZPR

PF30681 ZPR 27-77 aa

XP_057777869.1

76 aa

ZPR

PF30681 ZPR 1-43 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777866.1`	Pfam	`PF30681`	ZPR	Family	73	118	4.1e-13	50.2	Protein LITTLE ZIPPER
`XP_057777868.1`	Pfam	`PF30681`	ZPR	Family	27	77	1.5e-14	54.8	Protein LITTLE ZIPPER
`XP_057777869.1`	Pfam	`PF30681`	ZPR	Family	1	43	5.2e-13	49.8	Protein LITTLE ZIPPER

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921883.1
ATGATTATTGTGGCAGTGTGTTTCCCTTCTGTCTTTCTCCCTCTCACTCTCTCTCTACGTGAATTTTCCCTCTCTTTTTACTTTTCTCCACTATATATATTCAGCCGCTGTGCCTCTCATTTGTCACACTTCTACAAAACTTCCTTTCTTTCTTTTTACTGCCATTTCAAGAAGAAAAAGGCTCTTCTCGTCCAACAACTCTTCTTCCTCTCCTTCCAAAAGAAAATGGAAAAGCTGAACTCGAAATTGTACTTGGAGAA...

XM_057921885.1
TATATATATATATTCTTTCACCAAGGAAGTTAGGCAAAAGGCTTGTACATGGCTGCGTTTTTCTAGTAAACCTTATGAAGTTTGGTTTGTTATCCTTGTTTCCCACCAACAAACCAAAATCTCAACTACTCTGCATGCTGCAACACACACACACACACATAGATGAACAGAGAAAAATGGAAAAGCTGAACTCGAAATTGTACTTGGAGAACTGCTACATCATGCAGGAGAATGAGAGGCTGAGGAAGAAGGCTGAGCTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130996589
ATGATTATTGTGGCAGTGTGTTTCCCTTCTGTCTTTCTCCCTCTCACTCTCTCTCTACGTGAATTTTCCCTCTCTTTTTACTTTTCTCCACTATATATATTCAGCCGCTGTGCCTCTCATTTGTCACACTTCTACAAAACTTCCTTTCTTTCTTTTTACTGCCATTTCAAGAAGAAAAAGGCTCTTCTCGTCCAACAACTCTTCTTCCTCTCCTTCCAAAAGAAAATGGAAAAGCTGAACTCGAAATTGTACTTGGAGAA...

LOC130996589
ATGAAGTTTGGTTTGTTATCCTTGTTTCCCACCAACAAACCAAAATCTCAACTACTCTGCATGCTGCAACACACACACACACACATAGATGAACAGAGAAAAATGGAAAAGCTGAACTCGAAATTGTACTTGGAGAACTGCTACATCATGCAGGAGAATGAGAGGCTGAGGAAGAAGGCTGAGCTTCTCAACCAGGAGAATCAGGCTCTCCTCACTGAGCTCAAGCAGCGCCTCGCCGCGGCCGCCGCCGTCGGAGCTCC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057777866.1
MIIVAVCFPSVFLPLTLSLREFSLSFYFSPLYIFSRCASHLSHFYKTSFLSFYCHFKKKKALLVQQLFFLSFQKKMEKLNSKLYLENCYIMQENERLRKKAELLNQENQALLTELKQRLAAAAAVGAPIPDLNMSTSAAATTSKAPKKNKK

XP_057777868.1
MKFGLLSLFPTNKPKSQLLCMLQHTHTHIDEQRKMEKLNSKLYLENCYIMQENERLRKKAELLNQENQALLTELKQRLAAAAAVGAPIPDLNMSTSAAATTSKAPKKNKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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